簡介 Markdown 是一種輕量級標(biāo)記語言,它用簡潔的語法代替排版,使我們專心于碼字。它的目標(biāo)是實(shí)現(xiàn)易讀易寫,成為一種適用于網(wǎng)絡(luò)的書寫語言。同時,Markdown支持嵌入h...
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小小的眼睛里,裝著……大大的疑惑 全文2800字,傷腦筋…… 今天嘗試把自己對于 stranded、reverse-stranded、un-stranded 這個問題的理解給...
年底復(fù)盤,發(fā)現(xiàn)很多知識點(diǎn)理解并不深入,想對這些不清晰的知識點(diǎn)重新梳理一下。 一、NormalizeData()歸一化 考慮到文庫測序深度的影響,我們需要對單細(xì)胞counts矩...
Seurat官網(wǎng):https://satijalab.org/seurat/articles/conversion_vignette.html[https://satijal...
挖掘公共單細(xì)胞數(shù)據(jù)集時,會遇到常見各種單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)格式?,F(xiàn)總結(jié)如下,方便自己日后調(diào)用,以創(chuàng)建Seurat對象(1)barcodes.tsv.gz、features.tsv....
0. 問題導(dǎo)入 之前繪圖的時候,我經(jīng)常會去RGB顏色對照表[https://tool.oschina.net/commons?type=3]上手動去摘選顏色碼,然后手動粘到g...
CheatSheet 首先先放上 0-based 和 1-based 的cheatsheet FormatTypeUCSC Genome Browser tables(USC...
我突然發(fā)現(xiàn)我們的超算上有大名頂頂?shù)腅NCODE數(shù)據(jù)庫ATAC-seq的分析流程,對于個人而言也可以輕松安裝并進(jìn)行調(diào)用[https://github.com/ENCODE-DC...
文章來源:科研圈2018-05-12 北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院賈璐萌,李亭亭(李程研究組) 上回說到Hi-C更適用于研究大尺Hi度上的染色質(zhì)結(jié)構(gòu),而不適用于研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件之間的...