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奔跑的Forrest

ubuntu,Linux系統(tǒng)都可以的

完整轉(zhuǎn)錄組RNAseq分析流程（tophat2+cufflink+cuffdiff）

前一段時(shí)間跟著孟浩巍大神的視頻學(xué)習(xí)，在自己的小破筆記本上還是跑完了整個(gè)RNAseq差異表達(dá)的分析流程（ tophat2 + cufflink + cuffdiff ）雖然這個(gè)...

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提取列 對(duì)列進(jìn)行選擇 select 函數(shù) 提取行 對(duì)行進(jìn)行選擇 filter 函數(shù)slice（）：按位置提取行filter（）：提取符合特定邏輯條件的行。 例如，iris％>...

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重要操作 常見命令 高級(jí)命令 不進(jìn)入容器使用工具

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uniprot數(shù)據(jù)庫就是這樣的，蛋白差異比較小就歸為同一種蛋白，對(duì)應(yīng)到基因上就會(huì)出現(xiàn)一個(gè)蛋白對(duì)應(yīng)到多個(gè)基因上

uniport ID 轉(zhuǎn)換為 gene symbol（ID轉(zhuǎn)換）

網(wǎng)站 ID轉(zhuǎn)換網(wǎng)址[https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php] input 選擇 uniprot accession ou...

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@小茞 對(duì)的，沒有變化的，卸載子系統(tǒng)也和普通卸載軟件差不多

構(gòu)建生物信息學(xué)環(huán)境-1（Win10 Linux子系統(tǒng)的安裝）

生信的入門，如果實(shí)驗(yàn)室之前沒有人從事生物信息學(xué)的師兄師姐的話，其實(shí)入門還是挺麻煩的，如果再不懂電腦，缺少各種東西，就會(huì)特別麻煩。想要做生信分析自然少不掉的就是自己搭建一個(gè)生信...

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@小茞 子系統(tǒng)另外一個(gè)角度來看和一個(gè)軟件差不多，沒有切換一說，子系統(tǒng)運(yùn)行時(shí)，win系統(tǒng)也是運(yùn)行的，沒有特別大影響

構(gòu)建生物信息學(xué)環(huán)境-1（Win10 Linux子系統(tǒng)的安裝）

生信的入門，如果實(shí)驗(yàn)室之前沒有人從事生物信息學(xué)的師兄師姐的話，其實(shí)入門還是挺麻煩的，如果再不懂電腦，缺少各種東西，就會(huì)特別麻煩。想要做生信分析自然少不掉的就是自己搭建一個(gè)生信...

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準(zhǔn)備條件1 知曉snp位置，位于第 x 條染色體上 12345678 bp2 生成 .txt 文件，文件格式如下 第一列表示 snp 染色體位置第二列表示 snp 前 50...

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@Ryan_hehe 這樣應(yīng)該也沒有大問題

cuffdiff 產(chǎn)出文件說明（cuffdiff工具說明書）

這個(gè)文章詳細(xì)說明了 cuffdiff 操作過程中各命令意義以及產(chǎn)出的文件代表什么意思，哪些是用于下一步做可視化分析和go富集分析,kegg富集分析等(ps:markdown寫...

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@Ryan_hehe 應(yīng)該是產(chǎn)生了可變剪切，這個(gè)要看你后續(xù)怎么分析了，一般算總量的話應(yīng)該也不算錯(cuò)

cuffdiff 產(chǎn)出文件說明（cuffdiff工具說明書）

這個(gè)文章詳細(xì)說明了 cuffdiff 操作過程中各命令意義以及產(chǎn)出的文件代表什么意思，哪些是用于下一步做可視化分析和go富集分析,kegg富集分析等(ps:markdown寫...

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先下載 primer3 和 misa 相關(guān)文件 misa 相關(guān)文件放在百度云鏈接：https://pan.baidu.com/s/1C4eU30yyLr7iNGiuGEmPt...

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HI = 100×（Hi - Mi1）/（Mi2-Mi1）Hi ：雜交種平均值Mi1：母本平均值Mi2：父本平均值 HI 介于45-55之間屬于中間性狀HI < 45 為偏...