RNAseq常規(guī)做法是先篩選出差異表達基因，然后針對篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻、小麥GO信息提取 在進行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
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2020-12-17水稻、小麥GO富集分析 -
AgRenSeq一種不依賴參考基因組且能快速克隆R基因的GWAS方法個人總結(jié)：GWAS是復雜性狀相關(guān)基因定位的常用手段，其結(jié)果與參考基因組的選擇有關(guān)，若多樣性群體中的候選基因不存在于參考基因組，則無法鑒定。而Kmer-based GWAS則不...
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Fst、PI、TajimaD值的計算Fst值的計算 群體間分化指數(shù)fst,取值范圍0~1，值越大表明群體間分化程度越高，親緣關(guān)系越遠。 這個窗口大小和步長不影響結(jié)果 曼哈頓圖 首先上傳數(shù)據(jù)，每列數(shù)據(jù)類型都為數(shù)值...
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GWAS分析-說人話（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來到這里，已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計這輩子我也沒有想到，我把我最厭惡的東西寫出來， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼，大神請...
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群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個綜合指標。 在統(tǒng)計...
