RNAseq常規(guī)做法是先篩選出差異表達(dá)基因，然后針對(duì)篩選出來的差異基因做GO富集分析。 1.水稻、小麥GO信息提取 在進(jìn)行GO富集分析前首先要確定在你所使用的GO富集分析軟件...
發(fā)簡信
IP屬地：湖北
-
2020-12-17水稻、小麥GO富集分析 -
AgRenSeq一種不依賴參考基因組且能快速克隆R基因的GWAS方法個(gè)人總結(jié)：GWAS是復(fù)雜性狀相關(guān)基因定位的常用手段，其結(jié)果與參考基因組的選擇有關(guān)，若多樣性群體中的候選基因不存在于參考基因組，則無法鑒定。而Kmer-based GWAS則不...
-
Fst、PI、TajimaD值的計(jì)算Fst值的計(jì)算 群體間分化指數(shù)fst,取值范圍0~1，值越大表明群體間分化程度越高，親緣關(guān)系越遠(yuǎn)。 這個(gè)窗口大小和步長不影響結(jié)果 曼哈頓圖 首先上傳數(shù)據(jù)，每列數(shù)據(jù)類型都為數(shù)值...
-
GWAS分析-說人話（20）-單倍體關(guān)聯(lián)分析前言 來到這里，已經(jīng)漸漸不是人話了... 估計(jì)這輩子我也沒有想到，我把我最厭惡的東西寫出來， 居然是最多人看的...... 分析方法很多，這一小節(jié)吐槽官網(wǎng)的這一行代碼，大神請(qǐng)...
-
群體結(jié)構(gòu)——PCA分析概念 PCA（principal components analysis）即主成分分析。主成分分析也稱主分量分析，旨在利用降維的思想，把多指標(biāo)轉(zhuǎn)化為少數(shù)幾個(gè)綜合指標(biāo)。 在統(tǒng)計(jì)...
