IP屬地：江蘇
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單細胞數(shù)據(jù)處理小細節(jié)匯總1. Seurat對象查看當前的Assay 在進行了SCTransform操作后，矩陣默認會變成SCT矩陣，如果不加設置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
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002-尋找高變基因和降維畫tsne和umap
首先打開rstudio 打開后用getwd()查看當前工作路徑 如果路徑跟上次的不一樣，重新設置一下路徑 重新加載R包 加載數(shù)據(jù) 官方推薦是2000個高變基因，很多文章也有設...
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老板親自傳授的文獻閱讀方法前言 論一個氣場合適的導師的重要性。想起一個微信朋友前截圖 A：導師牛不牛，師兄師姐牛不牛，跟你牛不牛沒有關系 B：你錯啦，導師牛不牛，師兄師姐牛不牛，很大程度上決定我牛不牛...
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001-Seurat介紹和數(shù)據(jù)質控4.0 安裝包 加載所需要的包 清除環(huán)境， 讀取10x的數(shù)據(jù) BC10 文件夾內容 scRNA.counts是一個S4對象。S4對象就像一顆大樹一樣，有主枝干，有分枝。 創(chuàng)建...
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單細胞數(shù)據(jù)下載數(shù)據(jù)下載 文章數(shù)據(jù)一般存放位置 打開GEO網(wǎng)站GEO[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/] 單細胞原始數(shù)據(jù) Cell Ranger toolk...
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感謝 我也是卡在這里
R無法讀取用Excel另存的CSV文件？記錄我學習R語言踩的第一個坑
這是一個真實的故事！ 故事正文： 今天我在學習《R語言實戰(zhàn)》這本書，學到了數(shù)據(jù)的輸入，從帶分隔符的文本文件導入數(shù)據(jù)，書中講到了下面這個例子↓ 聽說學習R語言的好習慣就是要親手...
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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Linux下安裝 Miniconda和admixture-圖文解析1、用wget命令下載 wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64....
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Markdown 代碼塊與語法高亮
語法說明：插入程序代碼的方式有兩種：使用反引號 `（~ 鍵）、使用縮進（Tab）。 插入行內代碼，即插入一個單詞或者一句代碼的情況，使用 `code` 這樣的形式插入。 插入...
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ped 必須與fam 文件一起
你好是不是寫錯了。。。PED必須與map 文件一起GWAS分析-說人話（2）認識文件名
前言 認識文件名，這玩意太重要了！行外人看不懂?。。。。。。?高逼格的東西自己閱讀參考文件了，我只上最粗暴的！～ 尼馬的，給我記好了，不然在GWAS分析的路上活不下的！??！ ...
