前言 這年頭，誰還TM的做GWAS～ 今天導師不是想和你看流星雨， 是想和你看看他感興趣SNPs在某個亞組數(shù)據(jù)中的基因型....... 怎么辦？ I have 一堆SNPs，...
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GWAS分析-說人話（14）- 如何查看SNP的基因型
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GWAS分析-說人話（3）網(wǎng)絡數(shù)據(jù)下載后的處理前言 上天會告訴你那個文件才是需要用的嗎？ 不會！ 但我會?。c個贊，大個賞唄～） 數(shù)據(jù)下載后，相信我，小白連看哪個數(shù)據(jù)都會不知道的！ 當然，數(shù)據(jù)分析的第0章，數(shù)據(jù)下載，也不...
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CRISPR-Cas9基因編輯技術簡介CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術推出后的第三代基因編輯技術，短短幾年內(nèi),CRISPR-Cas9技術風靡全球, 成為現(xiàn)有基因編輯和基因修飾里面效率最...
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RNAseq常規(guī)流程轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個基礎和常見的分析流程，一般從下機數(shù)據(jù)開始，經(jīng)過一系列的質(zhì)控，基因組比對，差異分析等過程得到實驗組與對照組（或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組）中差異表達的基...
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生信分析學習筆記 - RNAseq （四） trimmomatic聲明：本文部分內(nèi)容和部分圖片來源于網(wǎng)絡。本文為生信小白學習筆記，不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權威。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預處理，序列回帖到數(shù)據(jù)可視化的工作流程，...
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我的生信之路--conda安裝和配置
做生信linux下最好用的下載軟件庫，非conda莫屬。 前2個月由于anaconda公司不給國內(nèi)鏡像授權，各大鏡像網(wǎng)站紛紛取消了anaconda的鏡像，終于在6月15號清華...
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學生信的那些事兒之十一 - RNAseq 分析流程之Conda安裝和軟件下載
理論上講，前面非?；A的Linux知識學到位之后是可以“開始”嘗試實戰(zhàn)一下RNAseq分析的上游部分的。 不過呢，如果把組學的分析想象成是做一幅畫的話，Linux基礎知識僅僅...
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轉(zhuǎn)錄組學習一（軟件安裝）
轉(zhuǎn)錄組學習一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學習二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學習三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學習四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學習五（reads的比對與samtoo...
