發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：陜西
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RNA-seq名詞解釋（8）（十）、分析流程及軟件列表 有參轉(zhuǎn)錄組：針對(duì)有參考基因組序列的物種進(jìn)行 mRNA 的分析。 無參轉(zhuǎn)錄組：針對(duì)尚無參考基因組序列發(fā)布的物種進(jìn)行 mRNA 的分析。 DGE：數(shù)字...
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RNA-seq名詞解釋（7）
（九）、分析內(nèi)容相關(guān) gene annotation：基因注釋，分為基因的結(jié)構(gòu)注釋和基因的功能注釋。 CDS predict：CDS(coding sequence)序列是編...
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RNA-seq名詞解釋（6）
（八）比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)相關(guān) 比較轉(zhuǎn)錄組學(xué)：（Comparative Transcriptomics）是一種快速、全面解析不同品系，不同亞種進(jìn)化關(guān)系，以及特定組織表達(dá)情況和關(guān)系的生...
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RNA-seq名詞解釋（5）
（七）分子標(biāo)記相關(guān) 分子標(biāo)記：是遺傳標(biāo)記的一種，直接在 DNA 分子上檢測(cè)遺傳變異。分子標(biāo)記能對(duì)不同發(fā)育時(shí)期的個(gè)體、組織器官甚至細(xì)胞作檢測(cè)，數(shù)量極多，遍及整個(gè)基因組，多態(tài)性高...
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RNA-seq名詞解釋（2）
三、建庫(kù)測(cè)序相關(guān)： library construction：文庫(kù)構(gòu)建，高通量測(cè)序前準(zhǔn)備步驟。針對(duì)不同的研究目的建庫(kù)方法不同。通常包括核酸樣品檢測(cè)、片段化、（擴(kuò)增）、加接頭、...
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2022.06.13學(xué)習(xí)測(cè)序基礎(chǔ)知識(shí)
參考De novo 測(cè)序基礎(chǔ)知識(shí) - Life·Intelligence - 博客園 (cnblogs.com)[https://www.cnblogs.com/leezx/...
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學(xué)習(xí)小組Day7-測(cè)序知識(shí)測(cè)序知識(shí) 思維導(dǎo)圖 名詞解釋 以下摘錄自生信星球 1.基因組學(xué)（核酸序列分析） （1）全基因組測(cè)序（WGS）（2）全外顯子組測(cè)序（WES）（3）簡(jiǎn)化基因組測(cè)序（RRGS）①R...
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名詞解釋：測(cè)序深度&RPKM、FKPM、TPM
測(cè)序深度(Sequencing Depth) 相當(dāng)于測(cè)了幾遍； 指測(cè)序得到的總堿基數(shù)（bp）與所測(cè)物種基因組大小的比值，其是評(píng)價(jià)測(cè)序量的重要指標(biāo)之一； 如：測(cè)序產(chǎn)生了1000...
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測(cè)序小知識(shí)之名詞解釋
1、Read depth Read深度：一個(gè)樣本測(cè)序得到的reads數(shù)；容易和基因組測(cè)序的覆蓋度 (多少基因組區(qū)域被測(cè)到了)和測(cè)序深度混淆 (單個(gè)核苷酸被測(cè)到的次數(shù)或所有核苷...
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單端測(cè)序與雙末端測(cè)序問題
問題 Paired-End測(cè)序與Mate-Pair測(cè)序相對(duì)于單端測(cè)序有何優(yōu)勢(shì)？ Paired-End中的Read1和Read2到底是啥關(guān)系？它們是如何參與拼接和比對(duì)的呢？ M...
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經(jīng)典：基因組測(cè)序數(shù)據(jù)從頭拼接或組裝算法的原理原作者：https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11596253.html https://www.cnblogs.com/leezx/p/5590...
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2020-10-13 第二代測(cè)序原理的詳細(xì)解析來源：https://zhuanlan.zhihu.com/p/91913739[https://zhuanlan.zhihu.com/p/91913739] 第二代測(cè)序原理...
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測(cè)序原理2021.3.9持續(xù)更新中。。。主要參考：生信曲線[https://www.bilibili.com/video/BV1oa4y1H7CU?t=31]、基因?qū)W苑[https:...
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振興中華！
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個(gè)人在線學(xué)習(xí)筆記
