Structurestructure下載地址[https://web.stanford.edu/group/pritchardlab/structure.html] Stru...
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遺傳多樣性軟件 Structure 使用說明 -
群體結構分析軟件Structure了解和使用一、簡介 Structure 是一個利用遺傳標記推斷群體遺傳結構的軟件。其功能包括推斷群體數(shù)目，判斷某個個體屬于哪個群體，鑒別遷移個體及雜合體等。舉個例子 上圖中顏色的種類即...
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君子以博聞多識為工，良史以實錄直書為貴。世事洞明皆學問，，人情練達即文章。
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使用Hisat2, Bowtie, Bowtie2和BWA對PE150進行比對-細菌轉錄組實戰(zhàn)
一、基因組下載及索引構建 1.1下載基因組 我下載的是支原體基因組，http://bacteria.ensembl.org/index.html[http://bacteri...
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fasta/fq文件處理萬能工具——Seqkit學習記錄
shenwei爪哥開發(fā)的處理Fasta/Fastq文件的萬能工具。之前處理fq/fa文件時花時間寫的一些腳本發(fā)現(xiàn)在seqkit里直接能一行命令就解決。實在是提升效率，整合流程...
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利用plink對snp質控的指標和基本流程
在拿到一組snp數(shù)據(jù)時，首先應該想到要對snp數(shù)據(jù)的質量進行檢測和控制。然后再考慮這組數(shù)據(jù)該怎么分析，如何分析。snp的質控是非常重要的，如果snp數(shù)據(jù)的質量不佳，那么計算的...
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chapter24:seqkit使用查看fastq總體信息 root:~/refs# seqkit stat duplicated-reads.fq.gz seqkit fx2tab 1.取序列名seqkit ...
