什么是Phasing? Phasing,或者說Genotype Phasing,它的中文名有很多:基因定相、基因分型、單倍體分型、單倍體構建等在不同的語境下都有人說過。但不管...
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與文章 【r<-安裝|方案】Windows R安裝與配置 相關。 存儲在 ~/.Rprofile 中的內容是一個 R 腳本,它會在 R 啟動時自動運行,所以可以作為全局的配置...
理論基礎 在上篇的比對中,我們需要糾結是否真的需要比對,如果你只需要知道已知基因的表達情況,那么可以選擇alignment-free工具(例如salmon, sailfish...
概況:使用處理后的fastq文件和基因組與轉錄組比對,確定在轉錄組或者基因組中的關系。在轉錄組和基因組的比對采取的方案不同。分別是ungapped alignment to ...
作者簡介 本文作者大可,四川大學華西醫(yī)院腫瘤中心科研搬磚工,研究興趣包括機器學習在高維組學問題中的應用,預測模型的開發(fā)與驗證。已發(fā)表多篇生信和機器學習相關sci文章。 編輯審...
答應大家今天要寫一寫關于多重插補的文章。查閱了很多資料,發(fā)現(xiàn)了一篇非常棒的英文文獻,翻譯給大家。 附上原文鏈接: 文章名稱:mice: Multivariate Imputa...
前言 在論文閱讀的過程中,經(jīng)常遇到使用特異性(specificity)和靈敏度(sensitivity)這兩個指標來描述分類器的性能。對這兩個指標表示的含有一些模糊,這里查閱...
傾向性評分匹配(propensity score matching, PSM)主要是在隨機對照試驗(Randomized controlled trials,RCT)中用于衡...
全基因組關聯(lián)分析(Genome-Wide Association Study, GWAS)是以連鎖不平衡(LD)為基礎,利用全基因組范圍內群體中高密度的分子標記,鑒定與復雜性...