HISAT2是一個(gè)快速和敏感的比對(duì)軟件，用于將二代測(cè)序數(shù)據(jù)（DNA和RNA）比對(duì)到基因組數(shù)據(jù)。 官網(wǎng)：http://daehwankimlab.github.io/hisat...
IP屬地：甘肅
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序列比對(duì) —— Hisat2 -
RNA-seq分析（STAR-RSEM-DESeq2）
一、準(zhǔn)備RNA-seq數(shù)據(jù) 需要參考基因組文件，注釋文件，樣本的fastq.gz文件 檢查fastq.gz是否完整 二、fastqc生成質(zhì)量報(bào)告（multiqc 提高查看效率...
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hisat2比對(duì)軟件將reads比對(duì)到參考基因組
轉(zhuǎn)載：https://biozx.top/hisat2.html[https://biozx.top/hisat2.html] HISAT2是TopHat2/Bowti2的繼...
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RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析一、安裝軟件 1、HISAT2 將reads比對(duì)到基因組上 2、StringTie 將比對(duì)好的reads進(jìn)行拼裝并預(yù)計(jì)表達(dá)水平 3、SAM tools 課上已經(jīng)用sudo a...
