T 細胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效應(yīng)T細胞）： 輔助...
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【單細胞轉(zhuǎn)錄組】人類T細胞亞群分析Marker基因匯總 -
免疫學筆記-1 | T細胞分化發(fā)育及其Marker1 關(guān)鍵細胞類型或Marker縮寫： 骨髓多能造血干細胞 HSC 淋巴樣祖細胞 lymphoid progenitor cell T細胞抗原識別受體 TCR 抗原提呈細胞 A...
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服務(wù)器管理之Linux如何查看哪個進程占用的SWAP分區(qū)比較多在日常管理中，我們經(jīng)常會遇到swap[https://so.csdn.net/so/search?q=swap&spm=1001.2101.3001.7020]分區(qū)使用比較多...
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小鼠基因富集分析之任何通路
今天忙里偷閑，自創(chuàng)了一套基于小鼠基因list的富集分析方法，主要原理是將之前用于人的基因富集分析方法搬運到小鼠上，大家可以各抒己見，在下方留言。 那么，開始展示 故事要從一個...
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STEP6:WGCNA相關(guān)性分析因為樣本數(shù)量比較可觀，所以可以進行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來做WGCNA分析，挑選的標準可以是top變異程度大的基因集合，或者顯著差異表達的基因集合等等。...
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cellchat版本更新了，請查看最新版本的tutorial，https://htmlpreview.github.io/?https://github.com/sqjin/CellChat/blob/master/tutorial/CellChat-vignette.html
單細胞分析之細胞通訊：cellchat
這篇文章在2020年7月上傳到了bioRxiv（Inference and analysis of cell-cell communication using CellCha...
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關(guān)于以chatGPT為代表的人工智能的一些思考
最近這個chatGPT非常火爆，能聊天，有問必答，還能寫論文寫詩歌寫代碼，那我們?nèi)祟愲x取代還有多久？這東西會不會有自我意識？機器能不能有自我意識？讓我想到人工智能有一個著名的...
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@e0bcf884eb4f hhh，謝謝
谷歌云盤文件無法直接下載怎么辦？
今天在準備復(fù)現(xiàn)一篇Cell的文章時遇到一個問題，就是那篇文章的原始分析數(shù)據(jù)共享在谷歌云盤上了，即便家里的網(wǎng)速不慢，另外加之用上IDM下載器，但依舊無法直接下載。既然有這樣的需...
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生信技能樹新葉講師<br>這里是新葉的分身馬甲：信你個鬼<br>B站：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fspace.bilibili.com%2F2356770" target="_blank">https://space.bilibili.com/2356770</a><br>歡迎學習交流
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不管何時，也要努力的學習吖，加油?。?！
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將單細胞的表達矩陣輸出為matrix.mtx.gz
前言，今天在群里看到有人提出說遇到一個稀疏矩陣轉(zhuǎn)普通矩陣的報錯問題，感覺這個問題自己以后可能也有遇到，所以做了這個報錯的可能解決辦法的記錄。 這里舉出兩種語言去將單細胞的表達...
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服務(wù)器de novo部署shiny app到網(wǎng)頁上為了方便別人快速使用我們文章的數(shù)據(jù)，先前給自己的project開發(fā)了一個shiny app，現(xiàn)在需要把這個APP部署到網(wǎng)頁上，因此記錄下整個部署過程。使用的是個空白的服務(wù)器，...
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【zombie】如何查看并殺死僵尸進程?僵尸進程定義 In UNIX System terminology, a process that has terminated,but whose parent has n...
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R語言繪圖之圖片的局部放大（基礎(chǔ)知識）下面這張圖大家應(yīng)該常見吧 一張圖的局部放大，我們來實現(xiàn)一下， 示例數(shù)據(jù) 開始畫圖,先畫散點圖 好，開始局部放大 最后我們修改主題和風格 當然，可以進一步優(yōu)化，比如把細胞注釋的...
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[R語言] 單因素方差分析和多重比較示例數(shù)據(jù)集如下： 導(dǎo)入數(shù)據(jù)作簡單可視化 正態(tài)性檢驗 當分析小于50行的小樣本數(shù)據(jù)時，用Shapiro-Wilk 檢驗 當分析大于50行的大樣本數(shù)據(jù)時，用Kolmogorov-...
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conda操作-3 | Jupyter notebook安裝及其虛擬環(huán)境設(shè)置1. 在base環(huán)境中安裝jupyter notebook 2. 在base環(huán)境中安裝ipykernel 3. 在目標環(huán)境中安裝ipykernel 4. 在base環(huán)境中將目...
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monocle3 在linux 終端R可用，但在Rstudio server無法使用
問題，報錯其實很直接，就是有個動態(tài)庫找不到 解決嘗試一，重裝terra，但是依舊報錯，說明此方法不行 進一步查看原因，會發(fā)現(xiàn)其實就是 libgdal.so.20 => not...
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R語言中多線程運行程序
R 代碼的運行效率不高，因此有時候可以考慮并行運行程序。 #apply系列函數(shù) 實際不是并行 ##lapply() 接受一個向量或者列表作為處理對象，返回結(jié)果是是與輸入等長的...
