作者，追風(fēng)少年i 新的一周，新的開始，接上一篇，10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞的空間依賴性[http://www.itdecent.cn/p/1877c6688948]，這...
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10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞類型與生物學(xué)通路的空間依賴性 -
10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞百分比餅圖的繪制作者，追風(fēng)少年i 最近一直有人問我空間轉(zhuǎn)錄組的餅圖該如何繪制，如下圖 之前呢，說過一些，大家可以借鑒 10X空間轉(zhuǎn)錄組繪圖之細(xì)胞類型百分比餅圖和空間密度分布圖[https:/...
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這個(gè)世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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復(fù)旦研究僧，一個(gè)從計(jì)算機(jī)坑跳進(jìn)醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘的小白
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R語言代碼-繪制SCI發(fā)表級的nomogram及calibration圖需求描述 畫出paper里的nomogram圖和校準(zhǔn)曲線 出自https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1470-2045(...
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復(fù)現(xiàn)：純R代碼實(shí)現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度最近學(xué)習(xí)了生信菜鳥團(tuán)的純R代碼實(shí)現(xiàn)ssGSEA算法評估腫瘤免疫浸潤程度,想復(fù)制作者的流程，但是發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)不一樣的地方，所以重新整理流程，代碼主要來自原作者Juan_NF。 文...
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您好，對于legend的位置和大小您知道怎么調(diào)整嘛
使用pheatmap包繪制熱圖
加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類后的順序輸出
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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TCGA甲基化數(shù)據(jù)下載以及相關(guān)臨床信息整理之前的文章里已經(jīng)按照教程進(jìn)行了TCGA數(shù)據(jù)庫的一些練習(xí)（RNA-seq、芯片、生存分析），現(xiàn)在學(xué)習(xí)TCGA甲基化數(shù)據(jù)的分析過程。 參考文章：1.甲基化的一些基礎(chǔ)知識(shí)2.Mak...
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所以，樓主您現(xiàn)在知道這種log后的的表達(dá)值要怎么進(jìn)行下游分析了嘛，謝謝啦
2019-12-30 下載UCSC Xena中的RNA-Seq數(shù)據(jù)
網(wǎng)址為：https://xenabrowser.net/datapages/?cohort=TCGA%20Bladder%20Cancer%20(BLCA)&removeHu...
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學(xué)習(xí)小組Day5 --小朱大夫1.什么是R語言 R語言是一種編程語言，也是統(tǒng)計(jì)及手段和繪圖的環(huán)境，匯集多種函數(shù)，一般會(huì)使用Rstudio，Rstudio使R更加容易使用。 2.安裝R語言，本機(jī)已順利安裝，...
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2020-05-04 學(xué)習(xí)小組Day3筆記--小朱大夫
1.軟件管理 Miniconda 2.準(zhǔn)備工作 查看服務(wù)器版本 ： uname -a 3.下載Miniconda最新版本，通過谷歌搜索，官網(wǎng)下載 開始下載進(jìn)入自己之前建立的目...
