您好，我想請(qǐng)教一下Blacklist，是啥文件在哪獲得？
ATACseq 分析流程ATACseq 基本原理如下圖所示。真核生物 DNA 與核小體結(jié)合形成染色質(zhì)，結(jié)合的緊密程度是動(dòng)態(tài)變化的。當(dāng) DNA 需要復(fù)制或轉(zhuǎn)錄時(shí)，結(jié)合變得松散讓 DNA 暴露。暴露的 ...
IP屬地：廣西
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conda下載及安裝以前做生物信息都需要去各種各樣的生物軟件官網(wǎng)進(jìn)行軟件下載，不過(guò)現(xiàn)在有一個(gè)conda就夠了。它就像是我們windows系統(tǒng)里的360軟件中心，大部分軟件都可以通過(guò)它來(lái)進(jìn)行下載和...
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hopi_bai ·
您好，看了您的文章，在實(shí)操時(shí)R語(yǔ)言報(bào)錯(cuò)
Error in function (type, msg, asError = TRUE) :
error:1407742E:SSL routines:SSL23_GET_SERVER_HELLO:tlsv1 alert protocol version
請(qǐng)問(wèn)這是由于什么原因造成的呢？ -
exp.csv是RNAseq數(shù)據(jù)還是突變數(shù)據(jù)？
TCGA突變數(shù)據(jù)下載與處理
實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 1.在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載疾病BRCA的突變數(shù)據(jù)熟悉TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)與數(shù)據(jù)下載方法2.處理下載數(shù)據(jù)，將其變?yōu)榱袨闃颖拘袨榛虻男问讲⑤敵觯〝?shù)據(jù)處理過(guò)程中去掉同義突...
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TCGA突變數(shù)據(jù)下載與處理實(shí)驗(yàn)內(nèi)容 1.在TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)下載疾病BRCA的突變數(shù)據(jù)熟悉TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的結(jié)構(gòu)與數(shù)據(jù)下載方法2.處理下載數(shù)據(jù)，將其變?yōu)榱袨闃颖拘袨榛虻男问讲⑤敵觯〝?shù)據(jù)處理過(guò)程中去掉同義突...
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2萬(wàn)個(gè)基因cox回歸分析Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型（考克斯，1972年）是常用的統(tǒng)計(jì)在醫(yī)學(xué)研究調(diào)查的患者和一個(gè)或多個(gè)預(yù)測(cè)變量的存活時(shí)間之間的關(guān)聯(lián)回歸模型。基礎(chǔ)知識(shí)可見：R-回歸分析[https://mp.w...
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MSKCC Research Associate<br>別趕不上野心，又辜負(fù)了努力
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ggplot2超詳細(xì)講解一.基本概念 "一張統(tǒng)計(jì)圖形就是從數(shù)據(jù)到幾何對(duì)象(geometric object, 縮寫為geom, 包括點(diǎn)、線、條形等)的圖形屬性(aesthetic attribute...
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GEO數(shù)據(jù)表達(dá)差異分析1-1從GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載數(shù)據(jù) 1-2提取表達(dá)矩陣exp 1-3提取各樣本的分組信息 1-4調(diào)整exp的行名順序與pd列名完全一致 1-5提取芯片平臺(tái)編號(hào)，保存 2-1提取分組...
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2021-04-29 TCGA與GTEX數(shù)據(jù)下載數(shù)據(jù)庫(kù)背景介紹 TCGA，全稱：The cancer genome altas官網(wǎng)：https://cancergenome.nih.gov/[https://cancerg...
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@蘇牧傳媒 聯(lián)系了包的作者張子杰老師，只能在linux上安裝，windows不行
m6A-seq_analysis_workflow
github：https://github.com/scottzijiezhang/m6A-seq_analysis_workflow 網(wǎng)頁(yè)：https://scottzij...
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2021-03-04 blast+ 比對(duì)兩個(gè)denovo RNAseq序列
問(wèn)題描述：遇到一位同學(xué)他的SEQ數(shù)據(jù)是13年的，illumina雙端測(cè)序，而且是無(wú)參物種，分別是病毒和昆蟲拼接好的轉(zhuǎn)錄組序列。而且還不是同一批樣本。然而我比較熟悉RNAseq...
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2021-01-15TCGA|GEO可視化分析第2篇---KEGG|GO分析大全 沉迷工作的我[http://www.itdecent.cn/u/82c2c57a3f59] 導(dǎo)讀：之前講了如何...
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2020-12-16轉(zhuǎn)載：留著自己以后看workflowr簡(jiǎn)介 我們知道在win或者Linux上將自己的腳本上傳到GitHub上我們可以通過(guò)Git插件輕松完成，那么在R上我們也可以做到將R腳本或...
