一、背景介紹 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計(jì)：Bedtolols inter...
發(fā)簡信
IP屬地：伊利諾伊州
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Intervene: BED文件的intersect和繪制韋恩圖 -
CellChat：細(xì)胞間相互作用分析利器前言 我們知道，細(xì)胞間信息傳遞方式一個(gè)是細(xì)胞表面配受體的相互作用，另一個(gè)通過細(xì)胞產(chǎn)生的可溶性小分子，即細(xì)胞因子。在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中下游，有時(shí)候我們想看某幾種細(xì)胞類型之間的相互...
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基因組注釋文件(GFF,GTF)下載的四種方法
NCBI Ncbi 里包含現(xiàn)在最全的參考基因組數(shù)據(jù)，可以進(jìn)入FTP站點(diǎn)查看：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 這里的文件夾名為物種的拉丁...
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那令人困惑的比對(duì)工具選擇啊~
寫在前面的廢話 我可能不適合做科研，因?yàn)槲铱偸菍?duì)一些“沒有必要”的事斤斤計(jì)較~ 剛開始接觸二代測(cè)序時(shí)，是跟著Jimmy大神從RNA-seq開始入門的。那時(shí)候使用的比對(duì)工具是H...
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在 Pycharm 中玩轉(zhuǎn) GitHub（圖文詳解）
一、Git 的誕生 在1991年，大佬 Linus 構(gòu)建了開源操作系統(tǒng)，并命名為 Linux，隨后帶領(lǐng)全世界計(jì)算機(jī)愛好者逐漸完善系統(tǒng) 。這個(gè)系統(tǒng)可能有人陌生，有人熟系。Lin...
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Chip-seq分析流程以Targeting super-enhancer-associated oncogenesin oesophageal squamous cell carcinoma為例，...
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基于sklearn建立機(jī)器學(xué)習(xí)的pipelineScikit-learn Pipeline可以簡化機(jī)器學(xué)習(xí)代碼，讓我們的代碼看起來更加條理。 構(gòu)建pipeline的流程如下例子： 簡單來說主要流程就是：1). 對(duì)分類變量和...
