-2. 僅作筆記，僅介紹軟件的使用，不涉及原理 -1. 使用的是SNP的數(shù)據(jù)/vcf文件 https://github.com/DReichLab/AdmixTools 0....
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：安徽
-
Admixtools的使用 - 以D統(tǒng)計(jì)和f4統(tǒng)計(jì)(qpDstat)為例 -
從群體基因組數(shù)據(jù)推斷祖先
最近看了一篇綜述，粗略翻譯一下文獻(xiàn)：Padhukasahasram, B. (2014). Inferring ancestry from population genomi...
-
LInux命令行光標(biāo)移動(dòng)
當(dāng)在Linux命令行中操作時(shí)，以下是一些常用的光標(biāo)操作技巧：移動(dòng)光標(biāo)到行首：Ctrl + a移動(dòng)光標(biāo)到行尾：Ctrl + e移動(dòng)光標(biāo)到上一個(gè)單詞的開頭：Ctrl + ←移動(dòng)光...
-
R繪制優(yōu)美的進(jìn)化樹（基礎(chǔ)）這篇文章主要是介紹繪制進(jìn)化樹用的ggtree以及一些拓展包的基礎(chǔ)用法，因?yàn)間g系列繪圖的邏輯基本是搭積木，這種介紹性的文章能夠幫助快速的找到想要的“積木”以及拼接的方法，剩下...
-
基于Vcf文件進(jìn)行基因單倍型分析單倍型，是單倍體[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的簡(jiǎn)稱，在遺傳學(xué)上是指...
-
用R語(yǔ)言對(duì)vcf文件進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘.10 利用vcf信息判斷物種染色體倍數(shù)目錄 前言[http://www.itdecent.cn/p/729673778e43] 方法簡(jiǎn)介[http://www.itdecent.cn/p/d9bd081763...
-
PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析此視頻來(lái)自B站，是非常好和全的的一個(gè)GWAS操作的視頻，從開始準(zhǔn)備軟件下載，數(shù)據(jù)過(guò)濾，到最后的候選基因注釋。GWAS的實(shí)戰(zhàn)視頻https://www.bilibili.com...
-
【Linux小筆記】無(wú)root權(quán)限時(shí)如何安裝軟件
在服務(wù)器上經(jīng)常遇到需要安裝某個(gè)軟件包的時(shí)候發(fā)現(xiàn)需要root權(quán)限才可以執(zhí)行編譯以進(jìn)行安裝。那么除了向管理員申請(qǐng)superuser的權(quán)限這樣比較麻煩的處理以外就需要掌握如何在沒(méi)有...
