Smart is the new Sexy
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昆蟲學(xué)博士，分享實(shí)驗(yàn)Protocol、生物信息、科研繪圖、中國(guó)傳統(tǒng)術(shù)數(shù)學(xué)等。
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跑通GWAS，用這些腳本就夠了最近跑通了一遍GWAS分析，全程在linux操作，雖然具體還有好多需要微調(diào)的地方，先把代碼整理分享出來mark一下 前期準(zhǔn)備 1.理論知識(shí) 強(qiáng)烈推薦百邁客云課堂課程GWAS生...
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免疫學(xué)碩士一枚～<br>生信熱愛者但是小白一枚~<br>目前成就為0~<br>加油哦，一大波成就正在路上啦~<br>啾~豬莎要加油哦~
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SRA 數(shù)據(jù)下載自救指南還在羨慕海峽那邊的朋友下載SRA 快到飛起？還在難過用wget 下載數(shù)據(jù)經(jīng)常下載不完整？用了官方的下載工具還是慢的不行？這里有一個(gè)SRA 下載自救嘗試指南供你參考。 需要用到...
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簡(jiǎn)書不再更新，個(gè)人主頁 <a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fkaopubear.top" target="_blank">https://kaopubear.top</a> 郵箱聯(lián)系 hi@kaopubear.top
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ChIP-seq詳細(xì)分析流程參考生信技能樹1以及生信技能樹2只記錄從數(shù)據(jù)下載，到最終結(jié)果展示，具體生物學(xué)知識(shí)請(qǐng)自行查閱稍后關(guān)于ChIP-seq的背景知識(shí)我會(huì)再發(fā)布一篇文章。數(shù)據(jù)下載：數(shù)據(jù)存放地址關(guān)于環(huán)境...
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測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控和預(yù)處理之fastp
1. 引言 下機(jī)的FASTQ數(shù)據(jù)通常需要進(jìn)行質(zhì)控和預(yù)處理，以保證下游分析輸?shù)臏?zhǔn)確性。fastp軟件僅掃描數(shù)據(jù)文件一次，就可以完成FASTQC + cutadapt + T...
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GWAS 總體流程理解版
自己找了一些文章和視頻，先總結(jié)了一部分，后面再做補(bǔ)充和實(shí)操 一. 相關(guān)概念理解 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”，使用統(tǒng)計(jì)模型找到與性狀關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，用于分子標(biāo)記選擇...
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公眾號(hào)：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組、腫瘤免疫、單細(xì)胞組學(xué)
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使用trim_galore對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量控制-過濾寫在前面參考1[https://cloud.tencent.com/developer/article/1625193]參考2[http://www.itdecent.cn...
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FastQC數(shù)據(jù)質(zhì)控報(bào)告的詳細(xì)解讀
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 測(cè)序平臺(tái)編號(hào)，現(xiàn)在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33編碼 Total sequ...
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FastQC質(zhì)控報(bào)告解讀一般FastQC分析結(jié)果產(chǎn)生有2種類型的文件，一種.zip，一種.html。直接點(diǎn)擊.html文件，即可在瀏覽器中查看質(zhì)控結(jié)果報(bào)告。 Summary 首先是Summary，這...
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GEO上都是芯片數(shù)據(jù)嗎？GSE開頭的都是芯片嗎看過很多GEO數(shù)據(jù)挖掘的教程，一直都是芯片數(shù)據(jù)舉例。我自己也根據(jù)流程（Taolu）分析過好幾個(gè)geo芯片數(shù)據(jù)。一直有個(gè)疑惑， GEO上都是芯片數(shù)據(jù)嗎？ GSE開頭的都是芯片數(shù)...
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miRNA-seq分析流程參考0[https://cloud.tencent.com/developer/article/1054975]參考1[http://www.itdecent.cn/p/8...
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RNA-seq練習(xí) 第一部分（原始數(shù)據(jù)下載，提取fastq文件，fastqc質(zhì)控）原始數(shù)據(jù)來源于這篇文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50177 1.下載原始數(shù)據(jù)https://...
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中科新生命前身為中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院蛋白質(zhì)組研究分析中心（RCPA）
