此處與云養(yǎng)江停的文章有略微差距 一.SNP calling 參照文章gvcf文件與vcf文件 - 簡書 (jianshu.com)[https://www.jianshu.c...
發(fā)簡信
IP屬地：湖北
-
SNP calling及fst值的計(jì)算 -
轉(zhuǎn)載ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
轉(zhuǎn)自：生信技能樹這是目前發(fā)現(xiàn)不錯(cuò)的ATAC系列，原作者在簡書也有更新http://www.itdecent.cn/u/d5b900bea027 ATAC系列連載： ATAC...
-
-
-
柿子基因組測序與其性別決定系統(tǒng)的進(jìn)化分析寫在前面 前日，課題組每周小組會(huì)時(shí)排到我分享論文與研究進(jìn)展。我大體看了下近期植物小RNA相關(guān)研究報(bào)道時(shí)，發(fā)現(xiàn)bioRxiv上，日本Takashi課題組上傳了其所開展的柿子基因...
-
DAP-seq--研究轉(zhuǎn)錄調(diào)控新方法，不受物種限制、高通量、無需抗體，研究蛋白與DNA互作的新方法（體外ChIP-seq）一、 DAP-seq技術(shù)簡介 DAP-seq（DNA親和純化測序）技術(shù)服務(wù)——高通量檢測轉(zhuǎn)錄因子或DNA結(jié)合蛋白在基因組上的結(jié)合位點(diǎn)。 在功能基因組學(xué)和表觀遺傳學(xué)研究中，轉(zhuǎn)錄...
-
ChIP-Seq, DAP-Seq與ATAC-Seq技術(shù)優(yōu)勢對(duì)比及選擇
染色質(zhì)免疫共沉淀Chromatin Immunoprecipitation, ChIP技術(shù)是在活細(xì)胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)－DNA復(fù)合物，并將其隨機(jī)切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片...
-
ATAC-seq / ChIP-seq問題盤點(diǎn)
作者：snail編輯：angelica 引言 跟著阿拉丁一起學(xué)習(xí)的時(shí)間又到了～～ ATAC-seq利用DNA轉(zhuǎn)座酶（Tn5）切割開放的DNA區(qū)域并結(jié)合二代高通量測序技術(shù)來研究...
-
（1）ATAC-seq和RNA-seq聯(lián)合分析——原始數(shù)據(jù)的獲取
前言 以這篇文章 Chromatin Accessibility-Based Characterization of the Gene Regulatory Network ...
