本篇文章介紹R語(yǔ)言默認(rèn)熱圖函數(shù)heatmap 首先我們閱讀了說(shuō)明書(shū)(文章最后) ——————** heatmap說(shuō)明書(shū)**————— Draw a Heat Map Desc...
簡(jiǎn)介 三元圖(Ternary plot)1是描述三個(gè)變量之和為常數(shù)的質(zhì)心圖,其核心原理是: 等邊三角形內(nèi)任意一點(diǎn)到三角形三邊的距離之和等于其中一邊上的高(常數(shù)); 過(guò)等邊三角...
在之前的幾篇文章里,介紹了如何整合dada2的分析結(jié)果,并且已經(jīng)通過(guò)MicrobiotaProcess包轉(zhuǎn)化為了phyloseq對(duì)象,接下來(lái)先讓我們進(jìn)行一些基礎(chǔ)的可視化操作....
Lefse 最近在折騰lefse分析,linux下直接用conda安裝LEfSe沒(méi)成功(conda install -c biobakery lefse或conda inst...
介紹 三元圖通常用于三組數(shù)據(jù)兩兩比較,可以展示三組間的相對(duì)基因表達(dá)或者物種豐度等。 三元圖是重心圖的一種,它有三個(gè)變量,但需要三者總和為恒定值。在一個(gè)等邊三角形坐標(biāo)系中,圖...