發(fā)簡信
IP屬地：湖北
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ReadAlignChunk_processChunks.cpp:177:processChunks
在運行STAR時，報錯如下：ReadAlignChunk_processChunks.cpp:177:processChunks EXITING...
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如何用ENA下載GEO的原始數(shù)據(jù)ENA數(shù)據(jù)路徑下載 在GEO頁面找到BioProject或SRA的編號 SRA數(shù)據(jù)庫下載SRA文件還需要轉(zhuǎn)換，而ENA數(shù)據(jù)庫[https://w...
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文章中不同物種的基因和蛋白的標(biāo)準(zhǔn)命名及寫法小鼠標(biāo)準(zhǔn)命名：http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/gene.shtml[http://ww...
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CUT&Tag數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)-更新
fastqc 0.12.1 [#Nextera Transposase Sequence & PolyG] ktrim 1.5.0 alignm...
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兩個Bigwig文件相減
bigwigCompare --bigwig1 teatment_rep1.bw --bigwig2 control_rep1.bw --ope...
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5. Peak 注釋
在之前通過macs2得到了差異peaks的數(shù)據(jù)，現(xiàn)在利用ChIPseeker包進(jìn)行注釋。參考：CS2: BED文件[https://mp.wei...
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4.CUT&Tag 基礎(chǔ)分析&數(shù)據(jù)匯總2
需要文件：seacr/;bam/ 加載R包： 輸出文件:file1 = left_join(peakN, peakOverlap, by = c...
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3.CUT&Tag 基礎(chǔ)分析&數(shù)據(jù)匯總1
需要文件：bowtie2_summary/;bowtie2_summary/;fragmentLen/;binLen/ 加載R包： 設(shè)置路徑 輸...
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2.CUT&Tag 數(shù)據(jù)分析實戰(zhàn)（2）
接上回[http://www.itdecent.cn/p/1d826a65fd59]，得到 bedgraph 文件了。重要秘籍: In-dep...