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ENA數(shù)據(jù)路徑下載 在GEO頁面找到BioProject或SRA的編號 SRA數(shù)據(jù)庫下載SRA文件還需要轉(zhuǎn)換,而ENA數(shù)據(jù)庫[https://w...
小鼠標(biāo)準(zhǔn)命名:http://www.informatics.jax.org/mgihome/nomen/gene.shtml[http://ww...
fastqc 0.12.1 [#Nextera Transposase Sequence & PolyG] ktrim 1.5.0 alignm...
bigwigCompare --bigwig1 teatment_rep1.bw --bigwig2 control_rep1.bw --ope...
在之前通過macs2得到了差異peaks的數(shù)據(jù),現(xiàn)在利用ChIPseeker包進(jìn)行注釋。參考:CS2: BED文件[https://mp.wei...
需要文件:seacr/;bam/ 加載R包: 輸出文件:file1 = left_join(peakN, peakOverlap, by = c...
需要文件:bowtie2_summary/;bowtie2_summary/;fragmentLen/;binLen/ 加載R包: 設(shè)置路徑 輸...
接上回[http://www.itdecent.cn/p/1d826a65fd59],得到 bedgraph 文件了。重要秘籍: In-dep...