細(xì)胞類型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
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細(xì)胞類型鑒定--單細(xì)胞marker基因（持續(xù)修正） -
EGA(European Genome-Phenome Archive)數(shù)據(jù)申請下載2023-6-13更新 太大的數(shù)據(jù)還是放棄下載吧幾個月過去，本來以為pyega3不行的話ascp肯定行結(jié)果43T下載下來17T，c4gh解碼失敗了一半有這些時間干點(diǎn)啥不好，裂...
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monocle2 擬時間分支點(diǎn)分析結(jié)果解讀How to map cell fate to branches? 擬時間分析結(jié)果有很多重要的結(jié)果，但是這些結(jié)果如何解讀？比如下圖的分支點(diǎn)分析結(jié)果： 從圖中可以看到，行代表基...
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monocle 軌跡圖改顏色我們在采用monocle做細(xì)胞擬時序分析的時候，常常會不滿意于原圖的配色，而軟件自帶的配色是根據(jù)降維后分出的cell type進(jìn)行顏色的分類的 那么我們可以通過 來完成 參考...
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BayesPrism|反卷積R包的使用方法官方網(wǎng)站：BayesPrism Gateway[https://www.bayesprism.org/pages/tutorial_deconvolution] 參考文獻(xiàn)：C...
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fastq-dump、fasterq-dump和parallel-fastq-dump處理SRA文件的速度比較最近新發(fā)現(xiàn)一個工具——parallel-fastq-dump，能多線程運(yùn)行fastq-dump處理SRA文件，而且與另一個常用的多線程工具fasterq-dump相比，還有-...
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【單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組】人類T細(xì)胞亞群分析Marker基因匯總T 細(xì)胞（全部）：CD3+ Naive T cell: CD3, CD4, CCR7, CD62L+, IL-7R (CD127), THPOK Tef（效應(yīng)T細(xì)胞）： 輔助...
