The BioGRID interaction database: 2019 update BioGRID(Biological General Repository for...
發(fā)簡信
IP屬地：上海
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BioGrid:滿足所有各種互作關(guān)系數(shù)據(jù)需求的數(shù)據(jù)庫 -
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CIBERSORT：反卷積推測bulk中的細胞類型五一學了一個新的分析方法-CIBERSORT，這個包其實很早就想學的，因為現(xiàn)在一般的單細胞文章的套路，很難不用到它，那么它能干什么呢？它能夠推測出bulk RNA每一個樣本中...
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WSL2安裝ubuntu及修改安裝位置本人小白一枚，因為生信分析的需要開始學習Linux。使用visualbox等虛擬機運行Linux有時會沒有那么流暢，想試試看WIN10自帶的WSL2來使用linux。這里總結(jié)...
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【6】蛋白質(zhì)組學鑒定定量軟件之MaxQuant1.簡介 2016年，德國馬普所的Cox和蛋白質(zhì)組學領(lǐng)域巨擘Matthias Mann合作開發(fā)了MaxQuant軟件（MQ），并發(fā)表在nbt上，protocol也相應(yīng)發(fā)表在n...
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featureCounts 得到的counts計算 cpm、 tpm、FPKM
一、從上游輸出文件結(jié)果中獲取基因有效長度 一般而言，RNA-seq得到原始counts表達矩陣最常用到的上游軟件就是featureCounts和Salmon了，在這兩類軟件的...
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蛋白質(zhì)組學中對缺失值的處理
蛋白質(zhì)組學數(shù)據(jù)中經(jīng)常存在缺失值（missing values）,特別是對于非標記定量蛋白質(zhì)學（DDA或者DIA），都存在相當一部分缺失值。首先說說缺失值的產(chǎn)生機制： 完全隨機...
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featurecounts的使用說明官網(wǎng)：http://subread.sourceforge.net/ 一、原理 文獻參考：featureCounts: an efficient general purpos...
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如何進行高維變量篩選和特征選擇(一)？Lasso回歸01模型簡介 隨著海量電子病歷的挖掘，影像學、基因組學等數(shù)據(jù)進入醫(yī)學統(tǒng)計分析，經(jīng)常會面臨對高維變量特征選擇的問題，Lasso回歸是在線性回歸模型的代價函數(shù)后面加上L1范...
