原理我們已經(jīng)在前文中討論過了，這次主要是代碼實戰(zhàn) 1. 定義一個數(shù)據(jù)集 2. PCA主函數(shù) 3. 選出值最高的兩個PC 我們在PCA原理部分已經(jīng)講過了，十個樣本，會產(chǎn)生10...
IP屬地：廣東
-
用R做主成分分析（PCA）及基本參數(shù)的選擇 -
WGCNA學習：WGCNA分析實戰(zhàn)WGCNA筆記第三彈 WGCNA分析原理 WGCNA應用場景 WGCNA分析實踐 本代碼借鑒了生信技能樹的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA課程編寫，轉(zhuǎn)載請注明出...
-
WGCNA構(gòu)建基因共表達網(wǎng)絡詳細教程這篇文章更多的是對于混亂的中文資源的梳理，并補充了一些沒有提到的重要參數(shù)，希望大家不會踩坑。 1. 簡介 1.1 背景 WGCNA（weighted gene co-expr...
-
RNA-seq分析：從軟件安裝到富集分析詳細過程
RNA-seq分析簡潔版[http://www.itdecent.cn/p/72c871663e62],用重新下載的肝癌數(shù)據(jù)[https://www.ncbi.nlm.ni...
-
RNA-seq完整分析過程linux基本命令 第六章 Linux文件與目錄管理 極客學院服務器 高通量相關基礎知識 生信一百講 1、 Anaconda Anaconda是一個Python下和Canop...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進行富集分析clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個R包，可以用來做各種富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）、Reacto...
-
淺探富集分析中的超幾何分布當我們從測序數(shù)據(jù)中得到了一系列的基因后，我們需要研究這些基因都屬于那些通路，那些通路是跟我們研究課題相關的。為了解決這一問題，最常用的做法就是做通路注釋然后做通路富集分析，看...
