Introduction Shiny 是一個 R 包，可輕松地直接從 R 構建交互式 Web 應用程序。還可以在網(wǎng)頁上托管獨立應用程序或?qū)⑺鼈兦度?R Markdown 文檔...
發(fā)簡信
IP屬地：廣東
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開發(fā)一個Rshiny應用（基礎） -
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)---從原理到分析(Hisat2+Stringtie+Deseq2)一、 首先放一段illumina測序平臺的官方原理鏈接： https://www.bilibili.com/video/BV1Cx411p7dm[https://www.bi...
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寫了個小腳本autosnippy:自動cgSNP分析
最近寫了一個snakemake流程，方便自己跑SNP分析。目前還是需要手動編輯一個文件表，剩下就是直接等著收樹文件了。 安裝 首先克隆git clone https://gi...
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我的SNP calling和核心SNP(core SNP)聚類分析流程
個人進行SNP分析用的軟件是snippy[https://github.com/tseemann/snippy]，主要是可以一次批量完成。準備工作：1.待分析的序列文件（fa...
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八. SNP檢測和進化分析（Snippy）
一. 簡介 Snippy[https://github.com/tseemann/snippy]是一款用于SNP檢測的軟件，可以通過分析得到核心SNP，進行比對構建進化樹。 ...
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ReporterScore包(GRSA方法)正式發(fā)表于雜志Briefings in Bioinformatics最近，我開發(fā)的R包ReporterScore（GRSA方法）發(fā)表在Briefings in Bioinformatics上了，這是一種靈活的，可用于復雜多組學數(shù)據(jù)的功能富集新...
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浙江大學蔣超課題組合作ES&T：開發(fā)使用可穿戴被動采樣器對個體生物和化學暴露組與轉(zhuǎn)錄組進行縱向測繪我們實驗室的子諾師姐開發(fā)了一種新型的用于個體生物和化學暴露組縱向測繪的可穿戴被動采樣器：AirPie。目前可以在一個驅(qū)蚊扣差不多大小的device上分析出數(shù)千種化合物和微生物...
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KEGG 數(shù)據(jù)庫及API (2)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
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KEGG 數(shù)據(jù)庫及API (1)Introduction KEGG[https://www.genome.jp/kegg/]（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）...
