寫在前面的話 你既然點(diǎn)進(jìn)來(lái)了,說(shuō)明你多半用過(guò)這個(gè)軟件。但我猜,大多數(shù)人早期使用這個(gè)軟件的時(shí)候,一定是趕鴨子上架:因?yàn)橐媹D,所以必須會(huì)。 但你真的懂了么? 太長(zhǎng)不看系列 對(duì)于...
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寫在前面的話 你既然點(diǎn)進(jìn)來(lái)了,說(shuō)明你多半用過(guò)這個(gè)軟件。但我猜,大多數(shù)人早期使用這個(gè)軟件的時(shí)候,一定是趕鴨子上架:因?yàn)橐媹D,所以必須會(huì)。 但你真的懂了么? 太長(zhǎng)不看系列 對(duì)于...
100天生信-Day4 最近在做類ChIP-seq,看了一下使用ChIPseeker注釋peaks的方法,保存一下代碼: 參考教程:https://www.jieandze1...
Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測(cè)序片段(短讀 short reads)“覆蓋”的強(qiáng)度有多大? 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測(cè)序...
方法一:基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件、注釋文件gtf/gff3文件:ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub...
本期介紹一個(gè)測(cè)序質(zhì)控的工具包:RSeQC包,它提供了一系列有用的小工具能夠評(píng)估高通量測(cè)序尤其是RNA-seq數(shù)據(jù).比如一些基本模塊;檢查序列質(zhì)量,核酸組分偏性,PCR偏性,G...