解密基因如何折疊與調控，Hi-C技術成為了探索基因組三維結構與功能的重要工具。那為什么我們要做Hi-C三維基因組研究？它到底能為我們帶來哪些新發(fā)現？本文將為大家解答這些疑問。...
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為什么要做HIC三維基因組測序？（原理） -
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基因家族分析（7）種內共線性分析及circos繪圖
MCscanX 軟件用來做植物基因的共線性分析, 也可以做復制基因的分類分析，查看基因家族成員是否由 segmental 復制產生。 準備MCscanX 輸入文件 輸入文件準...
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探索Circos圖：視覺化基因相關性的強大工具在生物信息學中，Circos圖是一種常用的可視化工具，可以幫助研究人員直觀地展示基因之間的關系。今天我們將通過一個簡單的例子，帶您了解如何在R語言中繪制一個Circos圖。 ...
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科研繪圖模板之小提琴分面圖小提琴分面圖（Violin plot）是一種用于展示和比較數據分布的可視化圖形。它類似于箱線圖，但提供了更多關于數據分布密度的信息。小提琴圖的核心是小提琴形狀，這種形狀是通過...
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BSA分析（八）QTL-seqQTL-seq 分析 數據準備 親本、低值混池、高值混池 使用 qtlseq 軟件自動進行 qtlseq 分析 分步進行 QTL-seq 分析 1.構建基因組index 2....
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BSA分析（七）Mutmapmutmap 分析 數據準備：野生型親本、突變混池、參考基因組 使用 MutMap 軟件自動進行 mutmap 分析 分步進行 mutmap 分析 1.構建基因組index2...
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BSA分析（六）變異結果注釋變異注釋 annovar 和 SnpEff 都是比較常用的 SNP 和 INDEL 注釋軟件。 annovar ANNOVAR是一個高效的Perl 命令注釋工具，可實現對來自...
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BSA分析（五）變異檢測因業(yè)務拓展，想組建一個數據分析團隊（目前已有RNA-Seq、Chip-Seq、重測序與群體遺傳、基因家族、比較基因組、宏基因組、微生物多樣性16s/18s/ITS方向專業(yè)人員...
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FPKM、RPKM、TPM還在傻傻分不清？FPKM：Fragments Per Kilobase of exon model per Million mapped fragments(每千個堿基的轉錄每百萬映射讀取的...
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科研繪圖模板之箱線分面圖箱線分面圖（Boxplot Faceting）用于展示一個或多個分組變量的統(tǒng)計分布。通過將箱線圖按照某個分類變量的不同類別進行分組排列，可以方便地比較不同分組中數據的分布情況...
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科研繪圖模板之多組差異箱線圖多組差異箱線圖（Multiple Group Comparison Boxplot）是一種統(tǒng)計圖形，用于展示并比較兩個或更多不同組別或分類變量在數值分布上的差異。這種圖形特別...
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ggtree：一款強大的R語言繪制生物進化樹工具在生物信息學和進化生物學領域，樹狀圖（phylogenetic trees）是用來表示物種之間進化關系的重要工具。ggtree是一個基于ggplot2的R包，專門用于可視化進...
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PCAtools從入門到精通主成分分析（PCA）是一種非常強大的技術，廣泛應用于數據科學、生物信息學和其他領域。它最初是為了分析大量數據而開發(fā)的，以便揭示被分析的邏輯實體之間的差異/關系。它提取數據的基...
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WGCNA結果可視化繪圖WGCNA WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis）是一種用于分析基因表達數據的工具，旨在識別基因之間的共表達模...
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優(yōu)雅的繪制擬南芥基因結構圖示例 從擬南芥的基因組文件中提取染色體信息和基因密度信息，并將這些信息可視化為染色體圖。 首先，加載所需的R包：tidyverse：一組用于數據科學的R包，包括數據處理（如d...
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本科畢業(yè)于浙江大學，碩士畢業(yè)于復旦大學，浙大讀博ing。<br>如果沒有及時回復可以發(fā)送郵件：jlyq617@gmail.com
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科研繪圖模板之基因結構圖基因結構圖是用來展示基因組中基因的組成和結構的圖表或圖形表示。它通常用于解釋基因的功能和組織方式，以及基因內部不同功能區(qū)域的位置和作用。 以下是基因結構圖中可能包含的一些主要...
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科研繪圖模板之韋恩圖韋恩圖（Venn Diagram）是一種用于可視化集合之間交集和差異的圖形工具。它以圓形的方式展示了不同集合之間的重疊和獨立關系，使觀察者能夠直觀地了解元素的分布情況。 韋恩...
