Pophelper基本說(shuō)明 群體遺傳下游分析中的一項(xiàng)常規(guī)分析即是群體結(jié)構(gòu)的分層展示(STRUCTURE ANALYSIS)，不同于系統(tǒng)樹和PCA，群體結(jié)構(gòu)分層可以分?jǐn)喑鲂∪后w...
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群體遺傳 || Pophelper-群體結(jié)構(gòu)可視化學(xué)習(xí)
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Week4— chromVAR:預(yù)測(cè)染色質(zhì)可及性相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子第四周 2018— 06.11-06.17原文： chromVAR: Inferring transcription factor-associated accessibil...
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ATAC-seq生信分析綜述翻譯(Genome Biology)這是目前為止我看到過(guò)的關(guān)于ATAC-seq的最新綜述，感興趣的話值得一讀。2020.4.22更新：我看到一個(gè)公眾號(hào)也翻譯了這篇文章，而且正好跟我這篇翻譯是在同一天發(fā)表http...
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轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)七（差異基因分析）
轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)一（軟件安裝） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)二（數(shù)據(jù)下載） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)三（數(shù)據(jù)質(zhì)控） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)四（參考基因組及gtf注釋探究） 轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)五（reads的比對(duì)與samtoo...
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轉(zhuǎn)錄因子富集分析轉(zhuǎn)錄因子富集分析 轉(zhuǎn)錄因子因子富集分析背后的原理與GO，KEGG等富集分析是一樣的。 這里還是使用Y叔的R包“clusterProfiler”。 首先我們要知道哪些基因是轉(zhuǎn)錄...
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基因組和轉(zhuǎn)錄組組裝質(zhì)量評(píng)估利器BUSCO（以大腸桿菌基因組質(zhì)量評(píng)估為例）基因組和轉(zhuǎn)錄組組裝質(zhì)量評(píng)估利器——BUSCO（Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs） 一，BUSCO簡(jiǎn)介 該軟件利用Ort...
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R 學(xué)習(xí) - 功能富集泡泡圖歡迎關(guān)注生信寶典，獲取更好閱讀體驗(yàn)。 http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247483978&idx=...
