懂得了那么多道理，卻依然過(guò)不好這一生。 所以理論歸理論，最終要落實(shí)到分析代碼上，咱們從這一篇開始，介紹一套擴(kuò)增子數(shù)據(jù)分析流程。 閑話少敘，首先介紹一下項(xiàng)目背景： 測(cè)序平臺(tái): ...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：天津
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病原微生物擴(kuò)增子數(shù)據(jù)分析實(shí)戰(zhàn)（一）：bcl2fastq軟件完成數(shù)據(jù)拆分
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Seurat學(xué)習(xí)與使用（一）簡(jiǎn)介 ??Seurat是一個(gè)r包，被設(shè)計(jì)用于單細(xì)胞rna-seq數(shù)據(jù)的細(xì)胞質(zhì)控和分析。Seurat旨在使用戶能夠識(shí)別和解釋單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的異質(zhì)性來(lái)源，同時(shí)提供整合不同類型...
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ATAC-seq分析干貨-2
作者 | Arno審稿 | 童蒙編輯 | amethyst 上一期我們介紹了ATAC-seq相關(guān)的背景知識(shí)。ATAC-Seq能幫助我們從全基因組范圍內(nèi)推測(cè)可能的開放染色質(zhì)位點(diǎn)...
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sc-ATAC-seq細(xì)胞類型注釋策略解釋任何單細(xì)胞測(cè)序數(shù)據(jù)的起點(diǎn)都是對(duì)給定數(shù)據(jù)集中的細(xì)胞簇進(jìn)行注釋。由于缺乏專門設(shè)計(jì)的工具以及在單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)中使用不直觀的順式和跨式調(diào)控元素（unintuitive...
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DNA鏈方向上的小疑惑
雖然是做生物信息的，但是經(jīng)常被一些基礎(chǔ)性概念所困擾……而我又是一個(gè)強(qiáng)迫癥，于是把這些亂七八糟的東西整理了一下，強(qiáng)行寫了一篇小文章。東西太雜，但是彼此相關(guān)，實(shí)在想不到什么合適的...
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「學(xué)轉(zhuǎn)錄組入門生信」四周實(shí)戰(zhàn)總結(jié)在四周之前，我寫了一篇推送一個(gè)月能通過(guò)轉(zhuǎn)錄組入門生信嗎？，于是開啟了我的‘四周通過(guò)實(shí)戰(zhàn)入門轉(zhuǎn)錄組’計(jì)劃?，F(xiàn)在四周結(jié)束了，我對(duì)這個(gè)計(jì)劃進(jìn)行一個(gè)階段性的總結(jié)。 答疑解惑 首先要感...
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RNA-seq(1) :用conda安裝RNA-seq所需要的工具
寫在前面: 來(lái)自生信技能樹《生信必修課之軟件安裝》學(xué)會(huì)用包管理工具安裝軟件 普通安裝和配置，請(qǐng)看這篇Linux下bowtie2安裝(非conda)和配置 注意 現(xiàn)在清華鏡像源...
