featureCounts結(jié)果的第六列不是基因長(zhǎng)度哦，好像是reads的覆蓋長(zhǎng)度
生信分析學(xué)習(xí)筆記 - RNAseq （六）FeatureCounts聲明：本文部分內(nèi)容和部分圖片來(lái)源于網(wǎng)絡(luò)。本文為生信小白學(xué)習(xí)筆記，不能保證專業(yè)名詞和內(nèi)容全部正確或權(quán)威。 下圖為某一條RNAseq從數(shù)據(jù)預(yù)處理，序列回帖到數(shù)據(jù)可視化...
Fastq格式文件儲(chǔ)存了生物序列的信息及其質(zhì)量信息。以電腦中的一個(gè)文件的為例 1 格式說(shuō)明 第一行：必須@開(kāi)頭，緊跟唯一的序列的ID標(biāo)識(shí)符，后面可跟其他描述性內(nèi)容，但序列ID...
寫(xiě)在前面的話 你既然點(diǎn)進(jìn)來(lái)了，說(shuō)明你多半用過(guò)這個(gè)軟件。但我猜，大多數(shù)人早期使用這個(gè)軟件的時(shí)候，一定是趕鴨子上架：因?yàn)橐?huà)圖，所以必須會(huì)。 但你真的懂了么？ 太長(zhǎng)不看系列 對(duì)于...
@塵世中一個(gè)迷途小書(shū)僮 謝謝提醒，后面自己設(shè)置了--very-sensitive的參數(shù)，允許一個(gè)錯(cuò)配，比對(duì)率提高了很多
CUT&Tag數(shù)據(jù)分析筆記（1）前幾天學(xué)習(xí)了文獻(xiàn)CUT&Tag[http://www.itdecent.cn/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟著官網(wǎng)來(lái)學(xué)習(xí)如何分析CUT&Tag數(shù)據(jù)了...
我最近也在分析150PE的，過(guò)濾后采用--local --very-sensitive --no-mixed --no-discordant --phred33 -I 10 -X 700 的比對(duì)率只有50%左右，不知道是不是這些默認(rèn)的參數(shù)不太合適？
CUT&Tag數(shù)據(jù)分析筆記（1）前幾天學(xué)習(xí)了文獻(xiàn)CUT&Tag[http://www.itdecent.cn/p/335aec753039]，了解了原理以后，可以跟著官網(wǎng)來(lái)學(xué)習(xí)如何分析CUT&Tag數(shù)據(jù)了...
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開(kāi)始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
WGCNA debug 運(yùn)行到這里報(bào)錯(cuò)：Error in (new("standardGeneric", .Data = function (x, y = NULL, use...
引物是PCR成功的關(guān)鍵因素之一，雖然PCR的穩(wěn)健性很強(qiáng)，有時(shí)讓人覺(jué)得似乎隨便用什么引物都能擴(kuò)增出來(lái)，但是精心設(shè)計(jì)的引物能夠明顯提升PCR的成功率，如果你經(jīng)常做PCR，這能為你...
--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具合集。能夠?qū)崿F(xiàn)二進(jìn)...
對(duì)本科成績(jī)要求高么？本科績(jī)點(diǎn)2.9。
國(guó)家公派留學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士申請(qǐng)過(guò)程記錄（1）非常幸運(yùn)自己今年申請(qǐng)到了國(guó)家公派留學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士的項(xiàng)目，自己申請(qǐng)的國(guó)家是英國(guó)，不知道有沒(méi)有關(guān)注公眾號(hào)的小伙伴是在英國(guó)留學(xué)呢？如果方便的話可以加我的微信，希望可以請(qǐng)教一些英國(guó)簽...
非常幸運(yùn)自己今年申請(qǐng)到了國(guó)家公派留學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)博士的項(xiàng)目，自己申請(qǐng)的國(guó)家是英國(guó)，不知道有沒(méi)有關(guān)注公眾號(hào)的小伙伴是在英國(guó)留學(xué)呢？如果方便的話可以加我的微信，希望可以請(qǐng)教一些英國(guó)簽...
DESeq2 multiple group comparison (biostars.org)[https://www.biostars.org/p/357464/]說(shuō)來(lái)也神...
