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發(fā)簡信
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請教一下作者，我要做不同門的幾個物種之間的基因家族擴張與收縮分析，對變異較大的基因家族過濾后再按照您的方法將λ值改為0.0001，但還是報錯You may want to try removing the top few families with the largest difference between the max and min counts and then re-run the analysis.請問有什么解決方法嗎？
比較基因組學分析2：基因家族收縮與擴張分析
比較基因組學分析目錄 1：單拷貝基因構建物種樹以及計算分化時間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴張分析[ht...
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繪制 SNP 密度圖一般使用 CMplot 繪制SNP密度圖：包鏈接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要繪制 SNP 密度圖，僅僅需要三列即可：a. 第...
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你好我對13個物種進行分化時間估計，提取到的4dtv位點只有172個，之后在用mcmctree運算時得到的接收比例第五列總是大于70%：36% 0.30 0.35 0.31 0.31 0.77，請您指教，是我的4dtv位點數(shù)太少了嗎。
mcmctree估算物種分歧時間
推斷物種系統(tǒng)發(fā)育關系以及分歧時間對探討物種起源與演化具有重要意義。通過最大似然法（ML）構建物種進化樹以及估算物種分化時間在比較基因組學的研究進展中已經成為了必不可少的“套路...
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卑微植物方向生信狗，從頭開始學起。<br>研究生奮斗1000天計劃進行中——
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個人博客: xuzhougeng.top (隨緣訪問)
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種菜小王，常做實驗，生信小白
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是在linux子系統(tǒng)下操作的，軟件是conda下載的，之前運行過一次顯示是成功的，但是后來怎么運行都會報這個錯誤
Aspera數(shù)據(jù)下載快速應用
本來下載數(shù)據(jù)用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面帶的prefetch，本來實驗室網速快還沒啥問題，但是這次碰到了一個硬茬，壓縮后數(shù)據(jù)15G，下載數(shù)次中斷，后來轉...
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你好我用aspera下載ena數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)的時候出現(xiàn)Session Stop (Error: Session data transfer timeout)
Aspera數(shù)據(jù)下載快速應用
本來下載數(shù)據(jù)用的是NCBI官方指定的sratool-kit里面帶的prefetch，本來實驗室網速快還沒啥問題，但是這次碰到了一個硬茬，壓縮后數(shù)據(jù)15G，下載數(shù)次中斷，后來轉...
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請問第四步里的spinach_pep_v1.fa是什么文件
Augustus 基因從頭預測
目前的從頭預測軟件大多是基于HMM(隱馬爾科夫鏈)和貝葉斯理論，通過已有物種的注釋信息對軟件進行訓練，從訓練結果中去推斷一段基因序列中可能的結構，在這方面做的最好的工具是AU...
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Seurat?4.0 ||單細胞數(shù)據(jù)分析工具箱有更新隨著單細胞技術的成熟，同一細胞內的信息越來越多被揭曉。在轉錄組時代，我們說單細胞是一個rna的盒子，細胞類型是基因特異性表達的結果?，F(xiàn)在，我們可以說單細胞是中心法則的反應器，...
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生信技能樹，生信菜鳥團，jimmy
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周運來，男，長大了才會遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細胞天地供稿人，簡書創(chuàng)作者，單細胞數(shù)據(jù)科學家。
