轉(zhuǎn)錄因子也稱反式作用因子,在動植物的生長發(fā)育及其對外界環(huán)境的反應中起著重要的調(diào)控作用,已成為現(xiàn)在生物學研究領域的熱點,其功能分析是重要的研究內(nèi)容之一。因此我們可以通過...
轉(zhuǎn)錄因子也稱反式作用因子,在動植物的生長發(fā)育及其對外界環(huán)境的反應中起著重要的調(diào)控作用,已成為現(xiàn)在生物學研究領域的熱點,其功能分析是重要的研究內(nèi)容之一。因此我們可以通過...
一:準備文件 1. 擬南芥的基因組,CDS,蛋白,GFF以及HMM文件。 2.利用HMM文件搜尋pep文件 3.利用clustalw進行多序列比對,構建物種特定的NB-ARC...
Genotype Imputation是在高通量測序中常出現(xiàn)的定義,按照義譯就是基因型填充。要真正理解imputation這個概念,我們就需要先理解基因型缺失(genotyp...
python讀寫文件的api都很簡單,一不留神就容易踩”坑“。筆者記錄一次踩坑歷程,并且給了一些總結(jié),希望到大家在使用python的過程之中,能夠避免一些可能產(chǎn)生隱患的代碼。...
這里是佳奧!我們繼續(xù)非模式種轉(zhuǎn)錄組的下游分析。 上篇我們拿到了raw count矩陣,但是我們還缺少很多東西,讓我們一步一步來。 1、選擇合適方法標準化表達矩陣 2、GO/K...
在實踐之前,我先查找了一下有關組蛋白修飾的知識點:(參考文章:http://www.itdecent.cn/p/8aca72809c5c) 組蛋白修飾能預測染色質(zhì)的類型(異...
基本概念 單體型:又稱單倍體型或單元型,是個體組織中,完全遺傳自父母雙方中某一親本的一組等位基因。擁有特定SNP的個體常常在附近某一特定變異位點擁有特定等位基因,這種關系叫做...
近日在《The new england journal o f medicine》雜志看到一篇文章的圖,如下,這種圖應該是用GraphPad prism做的,圖的特點是散點統(tǒng)...