一：數(shù)據(jù)準備 自己去下載擬南芥的基因組，gff3，CDS序列，pep文件。 1.根據(jù)gff文件獲得基因位置信息。 可以自己用awk抓，也可以寫個...
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基因家族分析十（基因家族加倍分析） -
MCScanX使用小記一篇不知道拖了多久的筆記……欠下的債早晚還是要還的…… 0.軟件下載及安裝 官網(wǎng)： http://chibba.pgml.uga.edu/mcs...
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MCScanX ‖ 安裝、報錯解決方法及簡單使用1.簡介： （1）介紹：MCScanX[http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/#tm]采用改進了的MCScan算...
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基因組共線性工具MCScanX使用說明MCScanX是檢測基因共線性和進化分析的常用工具之一，2012發(fā)表至今引用數(shù)200+，作者之一的唐海寶老師是國內(nèi)植物基因組學生信分析、軟件開發(fā)...
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物種內(nèi)共線性圈圖繪制，有那么難嗎？寫在前面 我受夠了！整天有人問，TBtools怎么畫這個圖 但是我其實只想回一句： 你畫這個圖干什么？有什么意義？你想說談什么生物學故事？ 承認...
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任何人！一鍵完成物種間的共線性分析與可視化寫在前面 類似的主題，我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性（MCScanX）分析》的文章。推出之后一部分人用著挺好。也有相當部分朋友卻不知為...
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基因家族分析5 || 共線性分析及可視化共線性分析（Synteny analysis）及可視化 基因家族流程：基因家族分析（一）[http://www.itdecent.cn/p/3...
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準備MCScanX運行及結(jié)果Ka & Ks 計算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個主要的功能, 一是, 方便...
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