（1）δaδi （2）G-PhoCS （4）PSMC （5）fastsimcoal （6）MCMC （7）stairway plot （8）Im...
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群體歷史推斷軟件匯總2021-0805
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自然雜交研究中有關漸滲和基因流的軟件2021-08-05
(1)Migrate-n （2)BayesASS3 (3)NewHybrids (4)parallelnewhybrid (5)introgre...
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學會正確選擇多序列比對（coding-sequences）軟件前幾天，實驗室的師弟師妹通過本地blast獲取一些沒有基因組注釋物種的蛋白編碼序列。原本以為可以快速地進行下一步的選擇壓力分析，沒想到卻在多序列...
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群體結構推斷軟件FastStructure安裝的詳細指南
此款軟件是基于SNP位點進行群體結構的推斷，運行速度比較快一些，本文主要介紹它的詳細安裝步驟。一、安裝fastStructure的依賴包和庫：C...
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鑒定全基因組變異（Variant Calling）軟件集錦
1.GATK （1）program language：C++ （2）Reference: （3）Manual： （4）Link： 2.DeepV...
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構建系統(tǒng)發(fā)生樹之軟件集錦（更新于2021.01.22）
2020.01.22更新內(nèi)容，補充了堿基替換模型軟件和貝葉斯樹軟件。 序言：一點筆記整理，希望對看到的同學，老師有所幫助！ 1.復雜的網(wǎng)絡狀進化...
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ipyrad分析RAD數(shù)據(jù)（官網(wǎng)給出）的詳細操作步驟（入門級）序言：目前（截止2020.04.01），針對RAD-seq數(shù)據(jù)的分析軟件主要有伊利諾伊大學厄巴納-香檳分校Catchen實驗室的STACKS和哥...
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群體結構推斷軟件集錦（更新于2020.03.20）
1.Structure Data Type：SSR datasets，SNP datasets Algorithm：EM，MM Manual：h...
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