title: muma-代謝組學(xué)單變量和多變量統(tǒng)計分析R包date: 2019-02-23 21:38:55tags: [單變量, 多元統(tǒng)計, ...
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muma-代謝組學(xué)單變量和多變量統(tǒng)計分析R包 -
MetaboAnalystR包靈活、可重復(fù)的分析代謝組數(shù)據(jù)R包文檔參考：https://www.metaboanalyst.ca/docs/RTutorial.xhtml#Workflow:%20Cas...
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潛在因素混合模型：LFMM—— R包lfmm在自然群體（區(qū)別于強(qiáng)人工選擇）中，如果我們感興趣的數(shù)量性狀表現(xiàn)出與特定的地理環(huán)境變量有高度的關(guān)聯(lián)性，隨著環(huán)境變量的改變而變化，則這些環(huán)境變量往往...
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用ropls進(jìn)行代謝組PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析簡介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是對變量數(shù)超過樣本數(shù)量或變量之間存在多重共線性的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化、回歸、分類和特征選擇的常用...
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R package：MAIT峰注釋
snThres表示的是信噪比參數(shù)的設(shè)置，rtStep生成峰文件的步長由于這里用的是示例數(shù)據(jù)，如果是自己的數(shù)據(jù)那么dataDir后接的就是自己設(shè)置...
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R package：MALDIquant質(zhì)譜峰的可視化安裝 查看MALDIquant包帶的數(shù)據(jù) 共有16個樣本 標(biāo)準(zhǔn)化 減少峰的波動，克服方差均值的相互影響
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R package（一）：xcms代謝組學(xué)初探xcms用于LC-MS和GC-MS數(shù)據(jù)分析，用于色譜分離和單光譜質(zhì)譜數(shù)據(jù)處理和可視化的框架。導(dǎo)入AIA / ANDI NetCDF，mzXML，...
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KEGG數(shù)據(jù)庫：查找某個通路上的所有基因
1.kegg數(shù)據(jù)庫下載 通常我們?nèi)绻阎硞€基因，想對這個基因做通路很簡單，直接用kegg的網(wǎng)頁注釋就可以；如果想知道某個通路里相關(guān)的所有基因列...
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eQTL就那樣～（1）前言 我還未想到這個專題叫什么...... 暫定“XXX就那樣”？ 我們先來個斗雞眼，看著一下中間的QT。 1.什么是數(shù)量性狀？（quantit...
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【代謝組學(xué)】代謝組學(xué)與其他組學(xué)數(shù)據(jù)的整合?主要內(nèi)容： 1.多組學(xué)數(shù)據(jù)整合概述 2.主要分析軟件匯總 3.數(shù)據(jù)預(yù)處理的方法 1.多組學(xué)數(shù)據(jù)整合概述 1.1多組學(xué)數(shù)據(jù)整合的現(xiàn)實意義 在研究...
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