單細(xì)胞分析不可避免的會涉及到鑒定不同細(xì)胞類型的功能或比較相同類型在不同狀態(tài)下的功能差異,因此,功能分析在單細(xì)胞分析中相當(dāng)重要. 功能分析的方法很...
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單細(xì)胞分析不可避免的會涉及到鑒定不同細(xì)胞類型的功能或比較相同類型在不同狀態(tài)下的功能差異,因此,功能分析在單細(xì)胞分析中相當(dāng)重要. 功能分析的方法很...
入門必讀:http://www.itdecent.cn/p/85e2e38df673 Q1:有的群2個或者3個不同細(xì)胞類型marker高表達(dá),...
在Linux上跑GSEA只是工程需要,在Windows上不能批量的跑;在單細(xì)胞數(shù)據(jù)上跑GSEA那是客戶的需要。有需要就需要被滿足,我們今天介紹一...
2020.11.19 Cell Ranger更新到了5.0版本。官網(wǎng)的更新說明包括以下三個部分: 一、關(guān)于基因表達(dá)和Feature Barcod...
劉小澤寫于2020.8.13主要分為兩個部分:前面用linux處理,后面用R處理 下載數(shù)據(jù) 選用的10X測試數(shù)據(jù)是:https://www.nc...
簡要內(nèi)容--擬時序分析的定義--結(jié)果解讀--------做出結(jié)果(cluster、state)--------確定起始點--------做sta...
我所理解的cellranger軟件理想原始輸入數(shù)據(jù)就是SRA格式,然后利用sra-tools分為read、barcode+UMI、index三個...
作者:seqyuan鏈接:單細(xì)胞軌跡分析知多少--擬時間分析比較來源:微信公眾號著作權(quán)歸作者所有,任何形式的轉(zhuǎn)載都請聯(lián)系作者。 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、蛋...
簡介: https://www.nature.com/articles/s41592-020-0748-5 https://www.biorxi...
最近遇到一個需求是將10X單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)按照barcode分割,一般分割文件我們首先想到bamtools split,具體用法可以參考之前記錄過...