上一個課程，我們對NetworkAnalyst在線工具進(jìn)行概述，簡單回顧一下，我們使用的NetworkAnalyst包括五個功能模塊，分別是 1...
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利用NetworkAnalyst在線工具對GEO數(shù)據(jù)庫中表達(dá)基因進(jìn)行差異分析 -
利用GEO2R進(jìn)行表達(dá)基因差異分析
GEO2R作為GEO在線工具，可以用于表達(dá)基因的差異分析。前面介紹過GEO數(shù)據(jù)包括五種，Platforms、Samples、Series、Dat...
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【轉(zhuǎn)載】癌癥基因組學(xué)研究全程回顧非常優(yōu)秀的研究總結(jié)，值得學(xué)習(xí)領(lǐng)會和思考。因為字?jǐn)?shù)太多，可以去作者的博文地址http://www.huangshujia.me/2017/01/0...
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GEO數(shù)據(jù)庫學(xué)習(xí)總結(jié)（一）數(shù)據(jù)下載
非常感謝jimmy大神與生信技能樹一直以來的無私分享，自己學(xué)習(xí)的同時也伴隨著記錄，如有錯誤的，歡迎大家指正~~~~ 1.數(shù)據(jù)下載 Ⅰ、R代碼直接...
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GEO數(shù)據(jù)庫學(xué)習(xí)總結(jié)（二）關(guān)于網(wǎng)頁下載一般R代碼下載其實挺好的，但是網(wǎng)絡(luò)狗是一件每個探索GEO小伙伴們都要經(jīng)歷的，有時候我們選擇更換鏡像，想避開蝸牛一般的的網(wǎng)速，但是也是不行，大家就...
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單因素和多因素cox回歸分析前面我們講過一個R函數(shù)搞定風(fēng)險評估散點(diǎn)圖，熱圖[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixi...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘篩選關(guān)鍵基因，然后實驗驗證的發(fā)文思路
科研資源不同，自然選擇就不同。沒有科研經(jīng)費(fèi)的人會比較喜歡純生信數(shù)據(jù)挖掘這種模式；有科研經(jīng)費(fèi)的人可能更喜歡生信+實驗這種模式。之前純生信數(shù)據(jù)挖掘的...
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教你3種方法下載NCBI GEO數(shù)據(jù)1.常規(guī)下載方式：prefetch ????對于常規(guī)下載sra數(shù)據(jù)來說，NCBI提供了它自己的一套工具(SRA-Toolkit)，其中用pref...
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人類癌癥數(shù)據(jù)庫TCGA-差異表達(dá)基因挖掘課程身處大數(shù)據(jù)時代，沒錢做實驗沒關(guān)系，無數(shù)人正在幫你做實驗積累數(shù)據(jù)；是嗎？是的！不信接著往下看！ 1. 目前公開的數(shù)據(jù)非常之多之前我們介紹了NCBI...
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抓住一個熱點(diǎn)，可以發(fā)無數(shù)篇純生信SCI
現(xiàn)在都是流行追熱點(diǎn)，例如m6A這個研究熱點(diǎn)，很多人利用它發(fā)了n篇純生信數(shù)據(jù)挖掘的文章；再比如鐵死亡這個研究熱點(diǎn)，有一大堆純數(shù)據(jù)挖掘的文章正在投稿...
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