背景 上次選擇了一個(gè)新開發(fā)的跨平臺(tái)歸一化工具 MatchMixeR，（失敗了），但是在文章里發(fā)現(xiàn)作者把自己的工具與已有的工具進(jìn)行比較，順藤摸瓜發(fā)...
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【搬磚】整理datasets——去除批次效應(yīng) -
2020年如何單純通過篩選基因發(fā)4+分
今天和大家分享的是2020年1月發(fā)表在Journal of Translational Medicine（IF：4.098）上的一篇文章，“Bi...
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非腫瘤單基因如何做免疫浸潤(rùn)？大家好，今天小編分享的是今年3月份發(fā)表在Diagnostics (Basel)(IF：2.489)的一篇非腫瘤純生信文章，“GRB10 and ...
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WGCNA學(xué)習(xí)：WGCNA分析原理本教程根據(jù)PlantTech的WGCNA課程編寫，課程還是不錯(cuò)的，所以將該課程給大家分享一下。 WGCNA筆記第一彈 WGCNA分析原理 WGC...
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跟風(fēng)學(xué)一波WGCNA聽說WGCNA是一個(gè)看上去比較厲害的轉(zhuǎn)錄組分析方法，近期又多次看到了相關(guān)的內(nèi)容，所以跟風(fēng)學(xué)習(xí)一下。對(duì)于我這種業(yè)余學(xué)生信的來說確實(shí)復(fù)雜了些，斷斷續(xù)...
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TCGA+biomarker——常見結(jié)果展示
在腫瘤研究領(lǐng)域，biomarker的研究以及相應(yīng)試劑盒的開始，是服務(wù)于腫瘤臨床的一個(gè)方向。這類研究項(xiàng)目依賴于大量腫瘤臨床樣本和機(jī)器學(xué)習(xí)算法。由于...
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18-IF6+:純生信分析甲基化和基因表達(dá)整合鑒定三陰性乳腺癌的預(yù)后標(biāo)志物和藥物靶標(biāo)
一.研究背景 三陰性乳腺癌(TNBC)臨床預(yù)后差，而且臨床上缺少有效的特異性生物標(biāo)志物。此外，三陰性乳腺癌具有雌激素受體(ER)、黃體酮受體(P...
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Cytoscape繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖導(dǎo)讀 用R軟件corr.test函數(shù)進(jìn)行兩組數(shù)組的相關(guān)性分析，用Cytoscape繪制相關(guān)網(wǎng)絡(luò)圖。 一、輸入數(shù)據(jù) 代謝數(shù)據(jù)：metabo.txt...
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從官網(wǎng)上下載TCGA數(shù)據(jù)不知從TCGA下了多少次數(shù)據(jù)了，每次都像失憶了一樣重新研究……果然凡事都該動(dòng)筆記下來 TAT本次以肝癌數(shù)據(jù)為例操作系統(tǒng)：MAC OS 1. 登陸...
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6分SCI（醫(yī)學(xué)類）-按這個(gè)思路很好發(fā)！
我們最近推出了一門重現(xiàn)6分醫(yī)學(xué)文章分析內(nèi)容的課程《TCGA-甲基化生存分析》，下面通過一篇6分SCI文章跟大家介紹一下該課程內(nèi)容。 該文章于20...
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