蛋白結(jié)構(gòu)分析在線軟件集錦 序列相關(guān) 密碼子表達(dá)優(yōu)化：Jcat 核酸翻譯為蛋白：Translate 序列比對(duì)和搜索：NCBI Blast，Unip...
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蛋白結(jié)構(gòu)分析在線軟件集錦
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ATAC-seq生信分析綜述翻譯(Genome Biology)這是目前為止我看到過(guò)的關(guān)于ATAC-seq的最新綜述，感興趣的話值得一讀。2020.4.22更新：我看到一個(gè)公眾號(hào)也翻譯了這篇文章，而且正好跟我...
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生信分析7：如何利用ATAC-seq數(shù)據(jù)鑒定轉(zhuǎn)錄因子活性前一篇推送解讀了2022年發(fā)表在DC上的關(guān)于擬南芥再生的文章。文章種利用TOBIAS鑒定了轉(zhuǎn)錄因子的活性。本次推送將介紹這款軟件的原理及使用。 ...
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DecontX - 去除單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中環(huán)境RNA污染
DecontX是一種通過(guò)去除RNA測(cè)序數(shù)據(jù)中非細(xì)胞信號(hào)的工具，它適用于單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)和高通量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)。https://github....
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nature microbiology圖表復(fù)現(xiàn)之聚類條形圖本節(jié)來(lái)復(fù)現(xiàn)nature microbiology上的一張帶聚類的條形圖，圖均基于ggplot2,ggtree，通過(guò)jjAnno很輕松的添加了陰影...
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Azimuth 注釋Azimuth 是Seurat那個(gè)組出的注釋工具。 有網(wǎng)頁(yè)版，有R包。 Azimuth annotation ? Azimuth (satija...
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KEGG Pathway通路二級(jí)分類匯總，輕松找感興趣的通路做完通路富集分析，拿到幾十條富集通路后，我們經(jīng)常會(huì)尋找與“某關(guān)鍵詞”相關(guān)的通路。例如與癌癥相關(guān)的通路，與免疫相關(guān)的通路，與代謝相關(guān)的通路等等。單...
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抗體編號(hào)系統(tǒng)抗體工程技術(shù)在藥物開(kāi)發(fā)中具有越來(lái)越重要的意義，并且已經(jīng)開(kāi)發(fā)了不同的生物治療劑，包括利用抗體片段，雙特異性抗體或抗體—藥物偶聯(lián)物。 然而，盡管它們...
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GSEA背后的統(tǒng)計(jì)學(xué)原理GSEA簡(jiǎn)介 基因集富集分析（GSEA）是一種計(jì)算方法，可確定先驗(yàn)定義的基因集是否在統(tǒng)計(jì)上顯示兩種生物學(xué)狀態(tài)之間存在顯著一致的差異。來(lái)自官網(wǎng)：G...
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GSEA結(jié)果解讀
上一篇GSEA可以做什么[http://www.itdecent.cn/p/1cc9f6c20ef6]之后，繼續(xù)進(jìn)行結(jié)果解讀 1 Enrich...
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