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SCENIC單細胞轉錄因子分析1. 簡介 SCENIC（single-cell regulatory network inference and clustering）是一個...
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10x HD圖片配準目前經手的10x HD數據，基本上都要進行圖像配準。建議先人工對齊，然后再進行spaceranger分析，以免分析完成后發(fā)現對不起齊，還要在調整...
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空間轉錄組-多樣本數據合并分析1. 讀入單個樣本 2. 合并數據 這里補充一點更新：合并空間數據后hvg怎么處理？從github上參考作者回復，有個函數來生成整體的hvg Y...
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多組cellchat數據分析
1. 合并多組數據 2.繪制兩組circle圖 3.繪制兩組bubble圖 更多詳情，可查看官方說明Comparison_analysis_of...
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scDRSMAGMA安裝 下載linux版本，在服務器解壓即可使用。 數據準備 gene location數據image.png reference da...
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使用GWAS分析與疾病相關的細胞類型
數據準備 https://zhuanlan.zhihu.com/p/467150143[https://zhuanlan.zhihu.com/p...
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DecontX - 去除單細胞轉錄組數據中環(huán)境RNA污染
DecontX是一種通過去除RNA測序數據中非細胞信號的工具，它適用于單細胞RNA測序數據和高通量RNA測序數據。https://github....
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TCGA數據下載及處理篩選數據，加入cart 從cart中下載需要的文件 紅框中為需要下載的文件。 我選擇了使用linux client和gdc_manifest.t...
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細胞通訊iTALK使用 - 獲取pathway LR信息使用方法參考大佬寫的就行 http://www.itdecent.cn/p/dfe35a2a02d4[https://www.jianshu....
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日拱一卒，功不唐捐??更多內容https://www.yuque.com/books/share/24352a21-d357-4bd2-b211-fbc801f0cb79?# 《大魚的生信筆記》