前言 很多關(guān)注我這個專題的朋友都在后臺留言,說想了解更多關(guān)于SNP過濾的東西。是的,確實(shí)這是一個比較重要的問題。第一,過濾到一些低質(zhì)量的SNP可...
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前言 很多關(guān)注我這個專題的朋友都在后臺留言,說想了解更多關(guān)于SNP過濾的東西。是的,確實(shí)這是一個比較重要的問題。第一,過濾到一些低質(zhì)量的SNP可...
寫在前面:當(dāng)學(xué)習(xí)某一重要文件格式時(shí),更需要對此格式對應(yīng)軟件工具進(jìn)行全面的學(xué)習(xí)(如sam/bam——samtools)。在多次花時(shí)間寫腳本處理文件...
群體進(jìn)化-gwas分析 群體進(jìn)化基礎(chǔ)分析 PCA 分析原理PCA(Principal Component Analysis),即主成分分...
部分摘自# VincentLuo91的博客 Part 1 VCF格式的學(xué)習(xí) 1.什么是vcf?VCF是用于描述SNP,INDEL和SV結(jié)果的文本...
在群體遺傳學(xué)研究中,LD連鎖不平衡分析是非常常見的內(nèi)容,同時(shí)也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ)。在很多的遺傳進(jìn)化GWAS的文章中都會出現(xiàn)LD衰減或者block單...