往期教程 「群體遺傳學實戰(zhàn)」第一課: 對SNP位點進行注釋 「群體遺傳學實戰(zhàn)」第二課: 畫出和文章幾乎一樣的PCA圖 SNP位點過濾 SNP過濾...
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往期教程 「群體遺傳學實戰(zhàn)」第一課: 對SNP位點進行注釋 「群體遺傳學實戰(zhàn)」第二課: 畫出和文章幾乎一樣的PCA圖 SNP位點過濾 SNP過濾...
科研繪圖是一項基本技能,之前為大家分享過一期我們組學大講堂繪圖工具合集:收藏貼-繪圖工具教程合集-科研必需技能!共20類37種繪圖方法,基本涵蓋...
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代碼,實現(xiàn)了導出gene2module 目的 最近有個項目又準備跑WGCNA,...
有兩種方法,先看比較簡單的一種: 結(jié)果: 第二種方法就比較復雜了,需要準備兩個文件:一個是包含染色體長度的文件chr_length.txt...
寫在前面 物種進化與基因進化,兩者總是生物學研究的關注點之一。物種進化的基礎,應是基因?qū)用娴难莼6蜻M化的基礎更多的來源于基因復制。常見的基...
motifmatchr的作用就是分析眾多的序列和眾多的motifs, 從中找到哪個序列包含哪個motif. 它的核心函數(shù)就是matchMotif...
背景 目前,已經(jīng)衍生出多種用于檢測染色質(zhì)開放性的試驗方法。比如, DNase-seq, FAIRE-seq和ATAC-seq,其中ATACA-s...
BioNano以cmap格式存放光學圖譜,為了評估基因組的組裝質(zhì)量或者了解光學圖譜中冗余情況(高雜合基因組組裝結(jié)果偏大),我們就需要進行cmap...
NextDenovo是武漢未來組胡江博士團隊開發(fā)的一個三代組裝工具,能夠用于PacBio和Nanopore數(shù)據(jù)的組裝。但是從官方的介紹而言,此工...
這是唐海寶老師GitHub上的JCVI工具的非官方說明書。該工具集的功能非常多,但是教程資料目前看起來并不多,因此為了能讓更多人用上那么好用的工...