系統(tǒng)發(fā)育樹幾乎是基因家族文章的必備圖，一個(gè)好看的樹圖的確能給文章增色不少，一般的用戶可能只使用MEGA繪圖，進(jìn)階一點(diǎn)的便會(huì)使用iTOL，evol...
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基因家族分析(4)ggtree繪制高端進(jìn)化樹 -
如何用WGDI進(jìn)行共線性分析(上)多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍化現(xiàn)象存在于大部分的物種中, 是物種進(jìn)化的重要?jiǎng)恿?。如果一個(gè)物種在演化過程中發(fā)生過多倍化，那么在基因組上就會(huì)存在一...
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文獻(xiàn)筆記二十一：PhenoGram可視化染色體上的信息文章題目 Visualizing genomic information across chromosomes with PhenoGram 發(fā)...
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其實(shí)MCScan畫圖也可以很好看最近發(fā)現(xiàn)了python版的MCScan，是個(gè)大寶藏。由于走了不少彎路，終于畫出美圖，趕緊記錄下來 github地址 https://github...
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Circos手把手極簡(jiǎn)入門（Windows篇）Circos是數(shù)據(jù)展示的一個(gè)極佳方式。是每一個(gè)男人都應(yīng)該學(xué)會(huì)的必備技能！ 如果按照我這個(gè)教程都搞不定的話，還是建議先別看別人的高階教程了。 Ci...
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基因組共線性工具M(jìn)CScanX使用說明MCScanX是檢測(cè)基因共線性和進(jìn)化分析的常用工具之一，2012發(fā)表至今引用數(shù)200+，作者之一的唐海寶老師是國內(nèi)植物基因組學(xué)生信分析、軟件開發(fā)...
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基因家族分析1 介紹 · 基因家族（Gene family），是來源于同一個(gè)祖先，由一個(gè)基因通過基因復(fù)制或者加 倍而產(chǎn)生兩個(gè)或更多的拷貝而構(gòu)成的一組基因，它...
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一文讀懂Ka/Ks
什么是Ka/Ks The ratio of the number of nonsynonymous substitutions per nons...
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Motif和domain的區(qū)別Protein domain： 結(jié)構(gòu)域的概念由Wetlaufer于1973年首次提出，他定義結(jié)構(gòu)域?yàn)榭梢宰詣?dòng)折疊的穩(wěn)定的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)單位。過去，結(jié)...
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轉(zhuǎn)錄因子詳細(xì)介紹(motif)TF: transcription factor轉(zhuǎn)錄因子TFBS: transcription factor binding site轉(zhuǎn)錄因子結(jié)...
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