拖拖拉拉用了一年時(shí)間才把GWAS整個(gè)流程捋完，從背景到code、還有過(guò)程中遇到的一些bug以及解決辦法，加起來(lái)也有二十余篇，按分析的流程整理出一...
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GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析全流程
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轉(zhuǎn)錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開(kāi), https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
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基因家族鑒定與分析關(guān)于基因家族鑒定及表達(dá)分析步驟，包括數(shù)據(jù)的獲取，軟件的使用，步驟流程。需要批量的重復(fù)步驟可使用腳本來(lái)完成。 1.1 此頁(yè)面下載 hmm文件 1...
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GSEA富集分析+R分析+多類(lèi)美化工具相關(guān)原理詳細(xì)介紹生信技能樹(shù)詳解GSEA[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mi...
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RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)（零）：RNA-seq流程前的準(zhǔn)備——Linux與R的環(huán)境創(chuàng)建前言：進(jìn)行RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)首先需要有一定的linux與R基礎(chǔ)，推薦跟著B(niǎo)站生信技能樹(shù)-jimmy老師學(xué)習(xí)打牢基礎(chǔ)：【生信技能樹(shù)】生信人應(yīng)該...
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【GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘】二、ID轉(zhuǎn)換相關(guān)原始代碼在這里： 1 查看表達(dá)矩陣 http://www.itdecent.cn/p/b69f1c84ecaa[https://www.j...
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RNA-SEQ（一）:上游分析前言 做RNAseq有半年了，最近比較有時(shí)間，所以想把流程記錄一下。并且搞清楚很多知其然而不知其所以然的細(xì)節(jié)步驟。 分析流程 從獲取原始數(shù)據(jù)，中...
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RNA-seq入門(mén)實(shí)戰(zhàn)（十一）：WGCNA加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析——關(guān)聯(lián)基因模塊與表型本節(jié)概覽1. WGCNA基本概念：定義、關(guān)鍵術(shù)語(yǔ)、基本流程、一些注意事項(xiàng)2. WGCNA運(yùn)行：?輸入數(shù)據(jù)準(zhǔn)備①判斷數(shù)據(jù)質(zhì)量，繪制樣品的系統(tǒng)聚類(lèi)樹(shù)...
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iTAK：在線(xiàn)預(yù)測(cè)全基因組轉(zhuǎn)錄因子TF，轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子TR與蛋白激酶PK前言 康奈爾大學(xué)，F(xiàn)eiLab的一個(gè)預(yù)測(cè)工具。 iTAK 是依賴(lài)于數(shù)據(jù)庫(kù)的用于從蛋白質(zhì)或核苷酸序列中識(shí)別植物轉(zhuǎn)錄因子 (TF)、轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子 (...
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大麥轉(zhuǎn)錄因子分析轉(zhuǎn)錄因子分析的流程 一、從轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù)庫(kù)下載大麥轉(zhuǎn)錄因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Transcription Factor...
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