Pandas與SQL對比 作為一名數(shù)據(jù)分析師，平常用的最多的工具是SQL(包括MySQL和Hive SQL等)。對于存儲在數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)，自然用...
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Pandas與SQL對比 -
淺探富集分析中的超幾何分布當我們從測序數(shù)據(jù)中得到了一系列的基因后，我們需要研究這些基因都屬于那些通路，那些通路是跟我們研究課題相關(guān)的。為了解決這一問題，最常用的做法就是做...
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數(shù)據(jù)探索之統(tǒng)計分布本文用Python統(tǒng)計模擬的方法，介紹四種常用的統(tǒng)計分布，包括離散分布：二項分布和泊松分布，以及連續(xù)分布：指數(shù)分布和正態(tài)分布，最后查看人群的身高...
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【系列】統(tǒng)計基礎(chǔ)（2）簡單理解t檢驗與z檢驗這一部分的內(nèi)容是后續(xù)所有算法的基礎(chǔ)的基礎(chǔ)。就是我們常說的各種檢驗，例如：t檢驗，Z檢驗，F(xiàn)檢驗，卡方檢驗等等。這些檢驗目的是告訴我們可以接受原假...
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統(tǒng)計分析中的各種A前言 在microbiome analysis中，有著大量的A，諸如PCA,PCoA，RDA,CCA,ICA之類的，網(wǎng)上介紹每一種的文章都十分的...
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pandas常用函數(shù)清單
1 import語句 2 文件讀取 3 數(shù)據(jù)預處理 4 數(shù)據(jù)篩選 5 數(shù)據(jù)運算與排序 6 數(shù)學統(tǒng)計
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The multiple testing problem, Bonferroni and FDR[多重檢驗問題及控制]
原文摘自生物秀,經(jīng)筆者編輯修改 數(shù)據(jù)分析中常碰見多重檢驗問題(multiple testing).Benjamini于1995年提出一種方法,通...
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假設(shè)檢驗p-value，F(xiàn)DR，q-value
一、p-value相關(guān) 0. 單個假設(shè)檢驗中主要依靠p值(或統(tǒng)計量t)做出是否拒絕零假設(shè)H0的決定：p-value和預先設(shè)定的檢驗水準alpha...
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基于有限樣本的假設(shè)檢驗方法分析
在樣本統(tǒng)計分析中，假設(shè)檢驗是最常見的一種數(shù)據(jù)分析形式，也是樣本分析中必不可缺的一部分。今天我們就從數(shù)據(jù)分析中的假設(shè)檢驗開始來分析下基于有限樣本的...
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使用泊松分布判定chipseq的蛋白結(jié)合位點
二項分布和泊松分布都描述的是事件成功次數(shù)的分布，泊松分布是二項分布的極限分布，其適用條件是n很大，p很小的情況。生物學中一些過程可以使用二項分布...
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