目前有多種方法可以進(jìn)行RNA velocity的分析: scVelo(參考文章:單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析|| scVelo 教程:RNA速率分析工具...
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目前有多種方法可以進(jìn)行RNA velocity的分析: scVelo(參考文章:單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析|| scVelo 教程:RNA速率分析工具...
今天抽個(gè)空把單細(xì)胞領(lǐng)域的GO KEGG GSEA GSVA都做了一遍,跑完以后的感覺就是有這樣的理解,就是單細(xì)胞我首先會(huì)選擇做GSVA,但是我還...
PMID: 路線圖 結(jié)果 1.ssGSEA分析代謝通路+PAM聚類 作者從MSigDB和KEGG收集了41條代謝相關(guān)通路,ssGSEA計(jì)算各個(gè)樣...
上一周Immugent寫了一篇一文解決單細(xì)胞亞群注釋的所有問題[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI4MjY...
一、背景 在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中,整合多樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分析逐漸成為一種趨勢。越來越多的研究者趨于使用未校正批次效應(yīng)后的數(shù)據(jù)進(jìn)行差異基因分析。他們認(rèn)為...
參考資料:參考生物技能樹[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官...
作者:Jenny審稿:童蒙編輯:angelica 前兩篇分享(單細(xì)胞ATAC概述[http://www.itdecent.cn/p/912c8...
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語言?[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)...
時(shí)代的洪流奔涌而至,單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕,飛入尋常百姓家。雪崩的時(shí)候,沒有一片雪花是無辜的,你我也從素不相識(shí),到被一起卷入單細(xì)胞天地。R...
前情回顧:單細(xì)胞時(shí)代 || 細(xì)胞身份概念的演變[http://www.itdecent.cn/p/c56313177a31]單細(xì)胞時(shí)代 || ...