單細(xì)胞rna測(cè)序(scRNA-seq)已被廣泛應(yīng)用于通過(guò)測(cè)量單個(gè)細(xì)胞的mRNA表達(dá)模式來(lái)發(fā)現(xiàn)新的細(xì)胞類型和重建發(fā)育軌跡。然而，使用不同的scRN...
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【單細(xì)胞工具】-FIRM-整合多平臺(tái)單細(xì)胞數(shù)據(jù)新算法 -
R語(yǔ)言-11利用sample函數(shù)抽樣
sample基本用法參數(shù)解釋：x表示所要抽樣數(shù)據(jù)，size表示抽樣個(gè)數(shù)，replace為T(mén)表示采取有重復(fù)的抽樣代碼目的：在1到10間有放回的隨機(jī)...
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R使用筆記：相關(guān)系數(shù):cor.test();corr.test();rcorr()本次筆記內(nèi)容：cor.test()和cor()rcorr() {Hmisc}corr.test() {psych}spearmanCI() {s...
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圈圖初探最近可能會(huì)用到圈圖，學(xué)習(xí)一下用R語(yǔ)言的circlize包繪制圈圖的方法，通過(guò)help（package="circlize"）查看幫助文檔看起來(lái)還...
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使用pheatmap包繪制熱圖加載所需R包 設(shè)置工作路徑 構(gòu)建測(cè)試數(shù)據(jù)集 將熱圖結(jié)果按聚類后的順序輸出
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ggplot繪圖的藝術(shù)-1：數(shù)據(jù)準(zhǔn)備在使用ggplot2進(jìn)行繪圖之前，我們需要先把數(shù)據(jù)整理成規(guī)范的格式。在R語(yǔ)言入門(mén)中我們了解到，ggplot2只支持tidy格式的數(shù)據(jù)，因此我們需...
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R-loop數(shù)據(jù)分析之R-ChIP(樣本間BAM比較和可視化)樣本間相關(guān)性評(píng)估 上一步得到各個(gè)樣本的BAM文件之后，就可以在全基因組范圍上看看這幾個(gè)樣本之間是否有差異。也就是先將基因組分成N個(gè)區(qū)間，然后用統(tǒng)...
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單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://ww...
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RColorBrewer與ggplot2如何用RColorBrewer包配置自己需要的顏色 使用RColorBrewer中默認(rèn)的顏色RColorBrewer中的配色方案可以說(shuō)是高大上啦...
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生信人應(yīng)該這樣學(xué)R語(yǔ)言--Jimmy，20講積跬步，至千里 1.介紹R語(yǔ)言及RStudio 1.1 安裝R 包和Rstudio1.2Rstudio四個(gè)區(qū)塊，區(qū)塊，history（to so...
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