共線性 共線性片段是指一個(gè)同一個(gè)物種內(nèi)部或者兩個(gè)物種之間，由基因組復(fù)制、染色體復(fù)制、大片段復(fù)制以及物種分化而產(chǎn)生的大片段同源現(xiàn)象。同源片段內(nèi)部基...
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MCScanX共線性分析 -
conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個(gè)胖友問...
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如何自定義circos圖的配色1.先來認(rèn)識(shí)一下circos的配色體系 下載安裝circos之后，在安裝目錄下面有一個(gè)png圖片，上面顯示的是circos支持的配色和字體樣式。...
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「JCVI教程」如何繪制CNS級(jí)別的共線性圖（中）在「JCVI教程」編碼序列或蛋白序列運(yùn)行共線性分析流程（上）還是有一個(gè)尷尬的事情，就是只用到兩個(gè)物種，不能展示出JCVI畫圖的方便之處，因此這里...
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基因家族分析5 || 共線性分析及可視化共線性分析（Synteny analysis）及可視化 基因家族流程：基因家族分析（一）[http://www.itdecent.cn/p/3...
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MCScanX-transposed安裝及使用1.簡(jiǎn)介 （1）MCScanX-transposed是基于在相關(guān)基因組內(nèi)和相互之間應(yīng)用MCScanX，能夠檢測(cè)不同時(shí)期內(nèi)發(fā)生的轉(zhuǎn)座基因復(fù)制的軟件...
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MCScanX使用小記一篇不知道拖了多久的筆記……欠下的債早晚還是要還的…… 0.軟件下載及安裝 官網(wǎng)： http://chibba.pgml.uga.edu/mcs...
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基因組共線性工具M(jìn)CScanX使用說明基因組共線性工具M(jìn)CScanX使用說明 簡(jiǎn)介 MCScanX工具集對(duì)MCScan算法進(jìn)行了調(diào)整，用于檢測(cè)共線性和同線性區(qū)域，還增加了可視化和下游...
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基因組共線性工具M(jìn)CScanX使用說明MCScanX是檢測(cè)基因共線性和進(jìn)化分析的常用工具之一，2012發(fā)表至今引用數(shù)200+，作者之一的唐海寶老師是國(guó)內(nèi)植物基因組學(xué)生信分析、軟件開發(fā)...
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