NTsys是一款強(qiáng)大的統(tǒng)計(jì)分析軟件，具有多個統(tǒng)計(jì)模型組件，在植物多樣性分析中經(jīng)常會用到。其中最主要的模塊是聚類分析，常用的方法有UPGMA、CL...
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UPGMA法聚類分析——NTsys2.10e -
GToTree做進(jìn)化樹
How to get phylogenetic tree from kraken or bracken output file?[https:/...
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計(jì)算分子進(jìn)化-搞懂PAML的正選擇分析許多基因組的文章里都會提到使用PAML進(jìn)行基因的正選擇分析(positive selection), 網(wǎng)上也有一些教程介紹如何用PAML進(jìn)行分析...
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比較基因組學(xué)的研究內(nèi)容
定義：在基因組序列信息已知的基礎(chǔ)上，對已知基因和基因的結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較，了解基因的功能，表達(dá)調(diào)控機(jī)制和物種進(jìn)化過程（簡單來說就是拿組裝好的基因組做比...
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每周文獻(xiàn)|小麥白粉病擴(kuò)展與全球貿(mào)易人類活動與病原物的擴(kuò)散息息相關(guān)。馴化和育種事件會加速病原物群體擴(kuò)張。小麥白粉病是由白粉病真菌(Blumeria graminis f. sp. ...
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dotPlotly 比較兩個不同組裝的效果可視化dotPlotly[https://github.com/tpoorten/dotPlotly]工具，是利用Ｒ語言寫的可視化Minimap...
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HYphy
Hyphy的官網(wǎng):https://www.hyphy.org/about/ Hyphy(Hypothesis Testing using Phy...
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物種馴化起源研究參考
群體遺傳中的馴化起源和基因流（基因漂移）分析是頂刊雜志最關(guān)注的亮點(diǎn)之一，能部分解答這方面的問題，IF應(yīng)該就不會低。 這里選取幾篇近幾年的相關(guān)研究...
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為什么要做基因家族（前言）基因家族的概念 基因家族 : 來源于同一個祖先，由一個基因通過基因復(fù)制而產(chǎn)生的兩個或多個拷貝而構(gòu)成的一組基因，他們在結(jié)構(gòu)和功能上面具有明顯的相似...
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分子進(jìn)化理論（11）蛋白質(zhì)進(jìn)化速率進(jìn)化速率 進(jìn)化速率既可指分子的進(jìn)化速率（蛋白質(zhì)或核酸等大分子中的氨基酸或核苷酸在一定時間內(nèi)的替換率），也可指某一類群的物種分化速率，甚至可指特定...
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