畫(huà)圖的過(guò)程中發(fā)現(xiàn)顏色太丑了，簡(jiǎn)單學(xué)一下配色。 RcolorBrewer包 看到有三種配色方法sequential： 生成漸變的顏色，標(biāo)記連續(xù)型數(shù)...
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R語(yǔ)言繪圖配色-RcolorBrewer包學(xué)習(xí)及進(jìn)階 -
Error: Bioconductor version cannot be validated; no internet connection?-2019-06-19
軟件安裝 出現(xiàn)如下錯(cuò)誤： Error: Bioconductor version cannot be validated; no interne...
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空間轉(zhuǎn)錄組第九講：利用SingleR進(jìn)行細(xì)胞類(lèi)型注釋
前面我們說(shuō)過(guò)空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)不是真正的單細(xì)胞水平，每個(gè)spot會(huì)捕獲5-10個(gè)細(xì)胞，這樣每個(gè)spot里實(shí)際上可能存在幾種不同類(lèi)型的細(xì)胞。但是對(duì)于大...
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GENIE3 || 基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)推斷前情提要：AUCell：在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組中識(shí)別細(xì)胞對(duì)“基因集”的響應(yīng)[http://www.itdecent.cn/p/2fb20f44da67...
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富集分析圈圈圖0.需求解讀 這是富集分析比較常見(jiàn)的一個(gè)圖，左圖右表。 圖的最外層是GOterm的編號(hào)，中間灰色背景層表示基因的logFC分布，可以看到每個(gè)te...
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ascp咋啦？如何從NCBI上下載sra數(shù)據(jù)？前言 今天（3.12日），想在NCBI上下載lncRNA數(shù)據(jù)，突然發(fā)現(xiàn)軟件Aspera的ascp（報(bào)錯(cuò)：ascp: Failed to open...
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安裝Aspera Connect工具下載sra數(shù)據(jù)
比較悲催的是現(xiàn)在下不了，查了很多沒(méi)有找到解決辦法 加上一個(gè)端口參數(shù) -P 33001，貌似可以下載了（今天2019.5.23晚上在摸索下） 一、...
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下載NCBI SRA數(shù)據(jù)的最佳方法
高通量的原始數(shù)據(jù)通常情況下會(huì)上傳到NCBI的SRA（Sequence Read Archive）數(shù)據(jù)庫(kù)。當(dāng)我們需要用到這些數(shù)據(jù)的時(shí)候，就需要合適...
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#分子模擬#同源建模從入門(mén)到精通（一）不管是藥物設(shè)計(jì)還是分子模擬，蛋白的結(jié)構(gòu)是必須的，結(jié)構(gòu)的好壞直接影響后期實(shí)驗(yàn)的可信程度。雖然許多蛋白晶體結(jié)構(gòu)已被解析，但仍有許多結(jié)構(gòu)未被解析，好在...
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R語(yǔ)言機(jī)器學(xué)習(xí)-caret介紹 caret包（Classification and Regression Training）是一系列函數(shù)的集合，它試圖對(duì)創(chuàng)建預(yù)測(cè)模型的過(guò)程...
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