歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中的platform代表測(cè)序平臺(tái)或者芯片平臺(tái),每一個(gè)platform用GPL開(kāi)頭的編號(hào)唯一標(biāo)識(shí)。對(duì)于一個(gè)...
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歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! 在mirdeep軟件的分析結(jié)果中,會(huì)提供miRNA前體的二級(jí)結(jié)構(gòu),這個(gè)結(jié)果實(shí)際上是通過(guò)調(diào)用RNAfold來(lái)實(shí)現(xiàn)的,該...
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! 預(yù)測(cè)miRNA結(jié)合位點(diǎn)的工具很多,以TargetScan為代表的工具,利用結(jié)合位點(diǎn)的保守性進(jìn)行預(yù)測(cè),對(duì)于大部分保守的...
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! TarBase是一個(gè)有實(shí)驗(yàn)證據(jù)支持的miRNA靶基因數(shù)據(jù)庫(kù),目前最新版本為v8, 經(jīng)歷了長(zhǎng)達(dá)10年左右的收集與整理,...
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! mRNA可以翻譯成各種功能的蛋白,其中有一類(lèi)研究調(diào)控蛋白研究的非常火熱,即轉(zhuǎn)錄因子transcription fac...
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊(cè)”! miRWalk是一個(gè)綜合性的miRNA靶基因數(shù)據(jù)庫(kù),收錄了人,小鼠等多個(gè)物種的miRNA靶基因信息,和mirDIP類(lèi)...