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上周為了督促自己有效的學(xué)習(xí)，立下了每周至少更一篇生信學(xué)習(xí)筆記的flag。 本打算從這周開始先寫一系列的生信基礎(chǔ)概念知識(shí)，沒(méi)想到很快就接到了大佬J...

一、背景介紹 通常，BED文件的overlap/intersect的操作，可以BEDtools intersect功能完成overlap和統(tǒng)計(jì)：...

趁著零碎的時(shí)間整理了下ChromHMM的相關(guān)內(nèi)容。 ChromHMM是基于ChIP-seq組蛋白數(shù)據(jù)檢測(cè)染色質(zhì)狀態(tài)的工具。 基因組區(qū)域特定的組蛋...

所謂：操千曲而后曉聲，觀千劍而后識(shí)器。 作為一個(gè)開源軟件，R的一個(gè)非常大的優(yōu)點(diǎn)就是我們可以隨意查看所有算法的源代碼，在對(duì)這些源代碼進(jìn)行分析的過(guò)程...

巨噬細(xì)胞吞噬實(shí)驗(yàn)作圖：

上篇文章中提了一下如何通過(guò)ggpubr包為ggplot圖添加p-value以及顯著性標(biāo)記,本文將詳細(xì)介紹。利用數(shù)據(jù)集ToothGrowth進(jìn)行演...

接下來(lái)會(huì)花時(shí)間認(rèn)真學(xué)習(xí)和理解熱圖，這篇文章以后會(huì)成為導(dǎo)航，有興趣的朋友可以收藏下。 Author: Zuguang Gu ( z.gu@dkfz...

這是ggplot2可視化專題的第二個(gè)實(shí)例操作 【ggplot2的基本思路見(jiàn)前文總論】：基于ggplot2的RNA-seq轉(zhuǎn)錄組可視化：總述和分文...

一般提到富集分析，首先想到的就是GO、KEGG這兩把刷子，然后還需要知道兩個(gè)重要概念：前景基因、背景基因 前景基因：你關(guān)注的要重點(diǎn)研究的基因集；...

1. 背景介紹 關(guān)于繪制臨床研究報(bào)告中亞組分析的森林圖，我過(guò)去幾乎試過(guò)了所有可能的工具，最早用繪制meta分析森林圖的方法繪制臨床研究亞組分析森...