論文 Reference genome assemblies reveal the origin and evolution of allohe...
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跟著NatureGenetics學(xué)作圖：R語言ggplot2做進化樹圖及添加不同形狀的背景色塊 -
群體選擇信號分析群體進化與選擇信號：●生活在世界不同區(qū)域的生物群體在歷史長河中經(jīng)歷千萬年的自然選擇、人工馴化、遷徙、遺傳漂變等事件的洗禮，有的物種滅絕，有的物種...
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11.GWAS：確定候選區(qū)間
確定了與表型顯著的SNP位點后，通常會選擇在顯著性位點所在位置前后，各一定的距離內(nèi)，確定候選區(qū)間，進行候選基因挖掘，而這個距離如何確定？9.5 ...
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PLINK+TASSEL做GWAS+Post-GWAS分析此視頻來自B站，是非常好和全的的一個GWAS操作的視頻，從開始準(zhǔn)備軟件下載，數(shù)據(jù)過濾，到最后的候選基因注釋。GWAS的實戰(zhàn)視頻https://w...
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GATK4測試學(xué)習(xí)
Getting-started-with-GATK4 GATK代表GenomeAnalysisToolkit。 它是用于分析高通量測序數(shù)據(jù)的命令...
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gatk4使用總結(jié)
昨天看了gatk的官網(wǎng)，從2018年發(fā)布正式版的4.0.0開始，到現(xiàn)在已經(jīng)更新到4.1.8，在速度和準(zhǔn)確度上都有了大幅的提升。gatk4除了整合...
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Samtools reheader
Usage 實操流程
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2021-05-07沒有bam文件沒有RG
問題起因：在用gatk進行HaplotypeCaller時，報錯 原因是在用hisat2或者bwa比對是沒有添加RG；hisat2（參數(shù)為--r...
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sambamba的安裝
下載文件 這個時候可能會報錯 這是因為沒有安裝ldc這個庫，那么就先來安裝ldc這個庫 然后再來安裝sambamba
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WES中常見問題匯總參考鏈接： https://mp.weixin.qq.com/s/awdjoXRYobrQAbXmAp3C0g gatk4的使用：https:/...
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